桌面网格计算平台在多序列比对算法中的运用.pdfVIP

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2017-08-11 发布于江西
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桌面网格计算平台在多序列比对算法中的运用.pdf

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201 计算机系统应用 1年第20卷第3期http：／／www．c．S-a．org．ca 桌面网格计算平台在多序列比时算法中的运用① 李金龙，贾晓雯 (浙江传媒学院电子信息学院，杭州310018) 台作为高性能编程环境和运行平台。分析了多序列比对算法在桌面网格平台上的任务划分方式、并行化策略和算法的研究具有参考价值。关键词：桌面网格计算；计算模型：序列比对；生物信息学；并行计算 to of Grid Platform Alignment ApplicationDesktopComputing MultipleSequence LI Xiao·Wen Jin—Long，JIA and ofMediaand 3 ofElectronic (College Information，ZhejiangUniversity Communications，Hangzhou10018，China) Abstract：Anew forClustalWwas anddescribedinthis parallelprocessingapproach presented paper．Thisapproach uses Grid isa ideafor asits Platform，which DesktopComputing promisinghighperformancecomputing environmentand Grid and strategy runningplatform．OnDesktopcomputingplatform,taskpartition，parallelism in is ofclustalW werediscusseddetail．ParaClustalWload program policy implementationtechnology algorithm considerationof andnumber orderto balanceswhichwas forits alignmentlength factors．In stronglysupported serialof also demonstratetheeffectivenessofthis simulation were done．Theresultsobtained approach,a experiments thatit a and the machine from show time same analysis gainedquickworking goodspeedup．Under