斐济病毒属植物病毒基因组结构研究进展.pdfVIP

中国化工学会农药专业委员会第十六届年会论文集 斐济病毒属植物病毒的基因组结构研究进展 李向阳，陈卓，金林红，薛伟，胡德禹 (贵州大学精细化工研究开发中心，绿色农药与农业生物工程国家重点 实验室培育基地／教育部重点实验室，贵阳550025) 摘要：近年来，斐济病毒属病毒新种如南方水稻黑条矮缩病毒的流行给我国水稻生产造成了严重损失。 因此对该病毒属的基因组结构的结构基因组学和功能基因组学的研究与分析对农业生产中该类病害的 防控研究具有重大的指导意义。 关键词：斐济病毒属；结构基因组学；南方水稻黑条矮缩病毒；水稻黑条矮缩病毒；玉米粗缩病毒 引言 结构基因组学是一门用结构生物学方法研究整个生物体、整个细胞或整个基因组中所有的蛋白质 和相关蛋白质复合物的三维结构的学科。主要利用实验方式(x射线晶体学、核磁共振谱学和电子显微 学)来测定蛋白质结构，同时结合同源建模(HomologyModelling)这一计算方式来推测蛋白质结构。 和传统结构生物学不同的是，利用结构基因组学所测定的蛋白质结构通常是功能未知的蛋白质。这令 科学家创立了结构生物信息学，利用三维结构信息来预测蛋白质功能。结构基因组学重视快速、高通 量(HighThroughput)的蛋白质结构测定，为斐济科等一些新种病毒的结构研究奠定了基础。 一、斐济病毒基因组结构的背景 Disease 斐济病毒(Fiji Virus)粒子有双层外壳，呈球形，直径65—70nm，无包膜。有12个 长和直径为11nIIl的A型突起位于二十面体的顶角处，不经过固定的病毒很容易在体外就裂解，形成 直径约55姗的内核，该内核具有12个长约8硼、直径约12nm的B型突起，某些试剂处理的玉米粗 nt)。 RiceBlack—streakedDWarf 南方水稻黑条矮缩病毒(Southern B1ackStreakedDwarf DWarfVirus，MRDV) 病毒(Rice Virus，RBsDV)和玉米粗缩病毒(MaizeRough 每一片段的正链都含有末端核苷酸保守序列。与保守的末端寡核苷酸序列相邻，每一基因组片段都有 反向重复序列，长度仅几个碱基。该属基因组RNA的G+c含量低，大多为34％一36％。蛋白质在纯化的 97、64 起应是由多肽III组成，多肽IV—VI形成病毒粒子的外层衣壳部分。在纯化的水稻黑条矮缩病毒电泳 中检测到3个主要多肽(130、120、56kDa)和3个量较少的多肽(148、65、5l kDa)。该病毒基因 无类似tRNA结构，在3’端具有高度保守的核苷酸序列(…GUC一3’)。大多数基因组片段为单顺反子， 得到了表达，但在昆虫或植物活体细胞内从来没有检测到第二个ORF的表达产物。病毒的S10片段可 能编码一个结构蛋白，在玉米粗缩病毒和水稻黑条矮缩病毒中具有高度同源性。该属侵染植物的病毒 ．17． 中国化工学会农药专业委员会第十六届年会论文集 复制发生在韧皮部相关细胞的细胞质中，伴随有病毒基质产生，感染过程中有直径约90nIIl的管状结 构积累，有时管状结构并不完全封闭，可形成卷筒状。 病毒存在于寄生植物韧皮部组织的细胞质中，有时也在筛管中大量积累，产生电子致密和较透明 的两类病毒基质，致密的病毒基质由直径55nm的未成熟病毒内壳组成，较透明的病毒基质由卷曲细 丝状物质组成，直径70nIII的成熟病毒粒子大量分布在病毒基质外围的细胞质中，不在细胞核内，玉 米粗缩病毒可形成结晶状排列的聚集体。在感病的细胞质中常可见到直径约90nm的管状物，病毒粒 子成纵列排在管状物中，有时这些管状物不完全封闭，成卷筒形。类似的病毒粒子和病毒基质也存在 于介体昆虫的脂肪体、唾液腺、菌胞体、消化道、肌肉、卵巢、表皮及脑细胞中…。该属有8个种， 发病最常见的3个种如下表l。 表1斐济病病毒亚组 中文名 学名