蛋白质组学在营养研究与应用.pdfVIP

保健食品技术研究与产品开发暨营养药脯交流研讨会 蛋白质组学在营养研究中的应用 吴健全，郭长江 (卫生学环境医学研究所，天津300050) 摘 要：随着蛋白质组学技术的日益发展和完善，蛋白质组学技术在许多研究领域都得到广泛应 用，并取得一系列令人瞩目的研究成果。蛋白质组学技术在营养研究中的应用虽然处于起步阶段， 但已经取得可喜进展，并表现出巨人的潜力和发展空间。在营养研究中充分利用蛋白质组学技术平 台，将带来新的研究思路和方法，有助于引导营养学研究向新的高度和深度发展。 关键词：蛋白质组；蛋白质组学；营养 在后基冈组时代，蛋白质的生物学作用重新受到重视。蛋白质是生命功能的执行者，更是细胞生命 活动的各种生物途径的调控者。蛋自质所特有的修饰加一[、转运定位、构象变化、分子间相互作用 等无法在基冈组水平得到阐明，这促使人们从蛋白质水平探讨生命现象及其活动规律。本文将结合 蛋向质组学的进展，综述蛋白质组学技术在营养研究中的应用。 1 蛋白质组学 1．1概念 蛋白质，或指一种组织、一种细胞或机体在特定时间或空间所表达的全部蛋白质[1]。蛋白质组的 研究领域还在不断扩展，最近从亚细胞层次进行研究的设想一经提出，即取得了～系列令人鼓舞结 果，如线粒体蛋白质组已成为研究的一个热点[2]。基冈组是相对稳定的，而蛋白质组则有明显的 组织特异性，甚至是在同一组织、同一细胞，不同的生长阶段或不同的环境卜．，其表达也可能有明 显不同，冈此蛋白质组的复杂性远远超过基因组。蛋白质是细胞功能的执行者，是基冈通往细胞功 能的纽带，因此蛋白质组能更真实、更直接地体现生命现象的本质，能更深入地揭示复杂生命活动 的规律。 进行定性和定量的比较研究，是对基因组编码的所有蛋自质鉴定，也是对不同转录条件下蛋自质表 达变化的复杂分析，其目的是从整体角度分析机体内动态变化的蛋白质成分、表达水平和修饰状态， 了解蛋白质问的相互作用和联系，揭示蛋白质功能与生命活动的规律，从而更深入地认识各种生理 和病理过程，明确疾病的发病机制，发现新的诊断标志物以及药物治疗的靶标[3]。根据研究范围 通常可分为表达蛋白质组学、结构蛋白质组学和功能蛋白质组学。 1．2基本技术 就技术方法而言，蛋白质组学研究技术比基因组学技术相对要复杂和困难。不仅氨基酸残基数量远 多于核苷酸残基(20／4)，而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰，如磷酸化、糖基化等，这给分离、分 析带来很多困难。蛋白质也不像基因那样能够在体外扩增，因此，在量上还受到限制。双向凝胶电 泳技术(two—dimensionaleletrophoresis，2-DE)、质谱技术(mass gel 物信息学技术(bioinformatics)是蛋白质组学研究的3大技术支柱[4]。 蛋白质分离的核心技术是2一DE，在2一DE中，蛋白质首先根据等电点的不同在第一向等电聚焦电泳 中分离，接着转移到第二向SOS聚丙烯酰胺凝胶上根据分子量大小的不同分离。随着吲相pH梯度等 电聚焦电泳技术的发展完善，使得2一DE技术获得广泛应用，成为首选的蛋白质分离技术。 质谱技术是目前在鉴定蛋自质的方法中发展最快、最具潜力的技术，具有高灵敏度、高准确性、自 ionlzatien，ESI)的发明， 使质谱技术得到迅速发展，成为蛋白质鉴定的核心技术。以MALDI为基础的肽质指纹(peptidemass fingerprint，PMF)、源后衰变(post—source 质谱(Tandem-Ms)的部分测序技术等，已经成为质谱鉴定蛋白质的主要方法。新近出现的一种被称 为基质辅助激光解吸电离四级飞行时间质谱技术，综合了肽指纹图谱方法的大规模和串联质谱直接 获得肽序列两方面的优点，可用于测定蛋白质或多肽的精确相对分子质量，并能测定较大分子的相 74 保健食品技术研究与产品开发暨营养药膳交流研讨会 对分子质餐。双向电泳与质谱技术的联合应用为蛋白质组分析提供了最基本的技术平台。 基下蛋白质组研究高信息量的特点，围绕蛋白质组开展的生物信息学研究也逐渐兴起，包括对2-DE、 质谱实验数据进行获取、加I：、存储、检索、分析、资源共享和开发等。蛋白质组学生物信息分析 由数据库、计算机网络和应川软件3部分组成，是蛋白质研究不可或缺的信息学手段。蛋白质组数 据库是蛋白质组学