睾丸特异性基因BAFL在人和小鼠中的表达及其生物信息学分析.pdfVIP

中国男科学杂志 2008年第 22卷第 10期 · 论 著 · 睾丸特异性基因BAFL在人和小鼠中的表达及其 生物信息学分析术 唐爱发 余振东 桂耀庭 郭 新 江智茂 蔡志明 北京大学深圳 医院，深圳市男性生殖与遗传重点实验 室 (深圳 518036) 摘要 目的 筛选 精予发生相关的基因。方法 将4d、9d、18d、35d、54d和6月龄小鼠睾丸组织cDNA探 针 Affymetrix令基 组芯片进行杂交，筛选出差异表达的基因。利用网络信息资源对陔基 进行，{：物学信息分析。RT— PCR分析该基 大[1存小 鼠年丸不 同发育阶段 4d、9d、1ld、14d、18d、21d、38d、6月龄及人和小 鼠不 同组织心、盯、 脾、肺、肾、脑、附翠和年丸中的表达 。结果 芯片结果分析筛选出 1个差异表达杂交点，生物信息学分析发现 差异点足BAFL基因，该 I太]全长 527bp，含有 273bp的完整 ORF，编码 90个氨基酸、相对分子量(Mr)为 10．266kDa的蛋门 质。RT—PCR分析表明小鼠mBAFL基 在小鼠21d龄睾丸及之 前没有表达，在 35d龄睾丸后开始高表达并特异性地表达 于睾丸组织。人hBAFL基冈在所检测的8种组织中，也只在睾丸组织中表达。结论 BAFL基因为辈丸特异性基 ， 小鼠mBAFL的表达 小鼠精子发牛的过程一致，可能在精子发生中起重要作用。 关键词 寡核苷酸序列分析； BAFL基因； 精 发生； 小鼠； 人类 中图分类号 Q2786； Q2492．4 Expressionandbioinformaticsanalysisofatestis—specificgene，BAFL， inhumanandmice TangAifa，YuZhendong，GuiYaoting，GuoXin，JiangZhimao，CaiZhiming ShenzhenKeyLabofMaleReproductionandGenetics，PekingUniversityShenzhenHospital，Shenzhen，518036，Guangdong Province，China Abstract 0bjective Toidentifynovelgenesinvolvedinspermatogenesis．Methods TestescDNAsamplesfromBalb／ CmiceofdifferentpostnataldayswereperformedwithmousewholegenomeAffymetrixchiptoscreenthetestis—specificgenes． Thecharacteristicsoftheselectedgeneswereanalyzedbyvariousbioinformaticstools．RT-PCRwasusedheretOidentifythe expressionprofileoftheselectedgenesinmicetestisandtissuesaswellashumantissues．Results Byanalyzingongenechip signalsofmicetestisaged4，9，18，35，54daysand6months，atestis—specificgene，BAFL，withadifferentialexpressioninthe developmentalstagesoftestiswasidentified．ThefulllengthcDNA of527bpofmouseBAFLgenecontainedanopenreading frameof273bpwhichencodedaputativeproteinof90aminoacidsandamolecularweightof10．266kDa．RT-PCR analysis showedthatBAFLgeneexpressedexclusivelyinmiceandhumantestis，andmouseBAFLg