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阳离子-amp;prod;相互作用CATION-amp;prod;INTERACTON.ppt
阳离子-∏相互作用CATION-∏ INTERACTON 非共价相互作用 一: 范德华力 二:氢键 三:∏-∏ 四:阳离子- ∏相互作用 阳离子- ∏作用 阳离子- ∏作用是一种存在于阳离子和芳香性体系之间的相互作用,被认为是一种新型的分子间相互作用。 Ma J C, Dougherty D A. The cation-π interaction. Chem Rev, 1997, 97: 1303—1324 Kim K S, Tarakeshwar P, Lee J Y. Molecular clusters of π-systems: Theoretical studies of structures, spectra, and origin of interactionenergies. Chem Rev, 2000, 100: 4145—4186 生物体系中的阳离子-∏作用 阳离子-∏作用广泛存在于生物体系中, 理论和实验研究均表明, 阳离子-∏作用对蛋白质结构稳定性及功能、蛋白质-核酸作用、受体-配体识别、药物-靶标的结合等起重要作用. Gallivan J P, Dougherty D A. Cation- π interactions in structural biology. Proc Natl Acad Sci USA, 1999, 96: 9459—9464 Gallivan J P, Dougherty D A. Cation- π interactions in structural biology. Proc Natl Acad Sci USA, 1999, 96: 9459—9464 蛋白质结构中典型的阳离子-∏作用 蛋白质结构中典型的阳离子-∏作用 阳离子-π作用分类 第一类是简单无机金属阳离子如Na+、K+,Mg2+和Ca2+和芳香体系之间的作用; 第二类是有机阳离子和芳香体系之间的作用; 第三类是分子中带部分正电荷的原子(如N—H键中的氢原子)与芳香体系之间的作用。 Zacharias N, Dougherty D A. Cation- π interactions in ligand recognition and catalysis. Trends Pharmcol Sci, 2002, 23: 281—287 阳离子-π作用分类 第一类阳离子-∏作用主要涉及蛋白质或核酸与无机金属阳离子的结合作用、 各种金属离子通道的选择性、以及一些金属有机复合物. Bellsolell L, Prieto J, Serrano L, Coll M. Magnesium binding to the bacterial chemotaxis protein CheY results in large conformationalchanges involving its functional surface. J Mol Biol, 1994, 238: 489—495 阳离子-π作用分类 第二类阳离子-∏作用的典型代表为乙酰胆碱(ACh)和乙酰胆碱酯酶(AChE)的结合作用。 Sussman J L, Harel M, Frolow F, Oefner C, Goldman A, Toker L, Silman I. Atomic structure of acetylcholinesterase from TorpedoCalifornica: A prototypic acetylcholine-binding protein. Science, 1991, 253: 872—879 阳离子-π作用分类 第三类阳离子-∏作用的强度比较弱, 通常为几个kcal·mol?1 (1 cal= 4.184 J), 甚至更小. 一个阳离子与多个芳香性残基侧链作用的现象. De Vos A M, Ultshc M, Kossiakoff A A. Human growth hormone and extracellular domain of its receptor: Crystal structure of the complex. Science, 1992, 255: 306—312 人生长激素受体的晶体结构 细菌周质配体结合蛋白ProX 的晶体结构 配体GB 与三个Trp 残基间的阳离子-π作用 阳离子-∏作用的实验和理论研究 早在1981 年, Sunner等人就发现在气相中阳离子可以
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