系谱分析中概率问题的贝叶斯分析一例.docVIP

系概率问题的分析何风华（华南师范大学生命科学学院 广州 510631） 《生物学通报》2007年第2期“遗传概率的一个认识误区”一文，给出了一个家系概率的答案，有详尽的分析，本文对此补充和完善。 下面某家族单基因遗传病系谱图，基因用A、a表示。请据图回答：Ⅱ2号的基因型概率是多少？ 系谱分析表明该病的遗传方式是常染色体隐性遗传。如果这个家系Ⅲ代表型未知，Ⅱ2的基因型为AA的概率是，为Aa的概率是。Ⅱ2和Ⅱ3生了患病个体，Ⅱ2就是致病基因携带者，此时Ⅱ2再生育一个患儿的概率为1/2。本例已知Ⅲ代有n个表型正常不能帮助我们定Ⅱ2的基因型很显然Ⅱ2为，。系概率分析Ⅱ2有n个正常子女的情况下，估计其基因型概率需要用贝叶斯（Bayes）定理贝叶斯贝叶斯定理P(Ci|E)等于未发生事件E时该原因出现的概率P(Ci)，乘以该事件对于该原因的概率P(E|Ci)，除以事件E发生的总概率。贝叶斯定理。贝叶斯贝叶斯定理Ci表示特定的基因型[1]。 贝叶斯Ci指Ⅱ2的基因型，E指Ⅱ2生育n个健康子女这一事件。贝叶斯分析包括4个层次的概率在未知Ⅱ2表型的情况下，我们认为Ⅱ2基因型的概率是前概率。Ⅱ2Ⅱ2的基因型Ⅱ2有2个正常子女的条件概率是1/2×1/2，有n个正常子女的条件概率是(1/2)n。整合这个家系提供的3个世代的信息，则Ⅱ2是致病基因携带者，同时他有n个正常子女的概率为前概率与条件概率的乘积，或2/3×(1/2)n。前概率和条件概率说明的两个事件同时发生的概率叫做联合概率。同理，Ⅱ2是纯合体AA的前概率是1/3；如果Ⅱ2就是正常的纯合体AA，那么他的后代必然全部表型正常，其条件概率为1，Ⅱ2是纯合子AA和有n个正常子女的联合概率为1/3×1=1/3。根据互斥事件的加法定理，Ⅱ2表型正常（基因型Ⅱ2各基因型的联合概率之和，或2/3×(1/2)n+1/3。再根据贝叶斯定理Ⅱ2在已生育n个健康子女的情况下是隐性基因携带者的后概率等于Ⅱ2为Aa的联合概率除以Ⅱ2各基因型的联合概率之和，或；Ⅱ2已有n个健康子女，并且Ⅱ2为正常纯合子AA的后概率为。我们可以通过列表（表Ⅱ2基因型的后概率。 表1 Ⅱ2基因型概率的Bayes分析 Ⅱ2是Aa Ⅱ2是AA 前概率P() 2/3 1/3 条件概率P(E|C) (1/2)n 1 联合概率P() 2/3×(1/2)n 1/3 后概率P(|E) 1/(1+2n-1) 2n-1/(1+2n-1) 如果Ⅱ2已生育2个健康的子女，那么他是致病基因携带者的概率由2/3降到了1/(1+22-1)=1/3。假若他再想要1个孩子，这个孩子患病的概率是多少呢？由于纯合子aa与携带者婚后生出隐性患儿的风险为1/2，故Ⅱ2再生育患儿的风险为1/3×1/2=1/6。可见，再生育子女的患病风险大大降低。当双亲或双亲之一的基因型不明确时，无论遗传病的遗传方式怎样，估计双亲生育某种患儿的概率要用He Feng-hua (College of Life Science，South China Normal University，Guangzhou 510631，China ) 附作者简介：何风华(1972.5-) 男，汉族，博士，副教授，主要从事遗传学的教学和科研。Tel: 020 E-mail: hefenghua2000@163.com 1