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肽核酸探针在微生物诊断领域中的应用
魏巍
澳斯邦生物工程有限公司业务研发中心,山东烟台,264006
Nucleic
摘要肽核酸(PeptideAcid,PNA)是DNA的模拟物,生物稳定性极高,与核酸
分子具有高度亲和性和特异性识别力。利用微生物rRNA高保守性可作为微生物分类的特
点,将微生物种属特异性rRNA序列作为肽核酸探针的结合靶标,已经成功的用于细菌、真菌
及寄生虫的快速诊断。本文就肽核酸的性质及其在微生物诊断领域的应用作一系统综述。
关键词肽核酸;微生物诊断;核糖体RNA
NueleicAcid,PNA)是1991年
肽核酸(Peptide
由丹麦科学家NielsenE嵋等设计的以中性酰胺键为
骨架的DNA类似物,其骨架结构单元为(2一氨乙
基)甘氨酸,碱基部分通过亚甲基羰基与主骨架氨基
连接,可以与DNA特异性结合。其骨架为电中性,
与DNA—DNA或RNA—DNA相比不存在静电排斥
作用,因此具有很高的核酸亲和性及热稳定性。目
前,PNA已应用于科研和微生物诊断领域,例如,基
因点突变的分析、染色体分析、人体病理学、病毒、真
菌[引、细菌[3]等。目前根据不同微生物的特点和诊 Pr●I●●■
断方法的要求进行微生物快速诊断主要有三种策 图1 蛋自、肽核酸及DNA的化学结构示薏图
略:1)分离培养后快速鉴定;2)短时间富集后检测;
比较PNA与DNA的结构发现,两者除了碱基
3)直接检测。针对rRNA的PNA探针已经成功运
外没有其他共同的功能基团,因此,两者的理化性质
用于以上三种方式,而且能够提供了更快速准确的
存在很大差异。PNA在酸性环境中相对稳定,而
结果,并在此基础上发展出多种检测模式,如基于玻
DNA用强酸处理可引起脱嘌呤。PNA氨基端的游
片的荧光原位杂交,基于滤膜的荧光原位杂交、化学
离氨基是不稳定的,特别是在碱性条件下,通过环闭
发光原位杂交、液相杂交、Q—PNAPCR等。随着以
合可发生N一酰化转移或氨基端的切割[4]。PNA为
rRNA多态性为基础的微生物分类学的发展,两者
电中性,与DNA相比水溶性较差,其溶解度与片段
结合正在共同推进微牛物诊断技术的快速发展。
长度和嘌呤嘧啶含量有关[5|。通过修饰(如嵌入带
1.PNA结构及性质
正电荷的赖氨酸残基)可以改变其溶解度,增强
1.1PNA的结构
PNA—DNA嵌合体的水溶性。在PNA末端连上溶
PNA在形态和空间结构上与DNA十分相似,
解度增强剂(E—linkers)也可增加其溶解度且不影响
两者都是由携带4种碱基的单体相连形成,这就保
证PNA能够依靠碱基互补配对原则识别相应的序
多数PNA探针及其应用都是很理想的,但Perry-
列,这也是利用PNA进行诊断的基础。PNA与
O
DNA的最大不同在于,DNA是由磷酸二酯键连接
ers可降低PNA的穿膜能力。目前PNA寡聚物浓
形成的磷酸戊糖骨架;而PNA则是由酰胺键连接
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