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瘦素受体基因Lys109Arg 多态性与非酒精性脂肪性肝病的关系
陈韶华 厉有名 姜玲玲 虞朝辉
浙江大学医学院附属第一医院消化科(310003)
近年来,非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD )的发病率逐年升高,已
引起广大医务工作者极大的关注,其发病机制也得到日益深入的研究。有研究证实瘦素受体参与
NAFLD 的发生和发展,本研究通过寡核苷酸芯片法检测 NAFLD 患者与正常人群瘦素受体
Lys109Arg 基因多态性(AAG-AGG 变异),分析其与NAFLD 发病的关系。
对象与方法
一、研究对象
收集浙江大学医学院附属第一医院接受体检180例成年人,分成2组:(1)NAFLD组117例,男
77例,女40例,年龄50.42±13.05岁;NAFLD 的诊断标准根据2002年中华医学会肝脏病学分会脂肪肝
和酒精性肝病学组制定的非酒精性脂肪性肝病诊断标准。(2 )对照组63例,男32例,女31例,年龄
49.13±14.52岁。所有入选对象均签署知情同意书。
二、临床资料
检测身高、体重、臀围、腰围、体脂、腹壁脂肪厚度和血压;并计算体重指数(BMI )=身高/
2 2
体重 (kg/m )和腰臀比=腰围/臀围。血标本用于检测甘油三酯、总胆固醇、高密度脂蛋白和血糖
水平。采用TANITA仪(TBF-300GS, TANITA Corporation of America,Inc )测定体脂含量(BF% );
腹壁脂肪厚度测量方法是嘱受试对象排空膀胱,平卧位,下肢屈曲,腹壁松弛,在脐下1cm处用左
手拇指和食指捏起皮肤和皮下组织,在皮褶根部用皮褶计测量腹脂的厚度,皮褶计的压力标准为
2
10g/cm 。
三、瘦素受体基因Lys109arg 多态性分析
1.标本的收集和处理
收集人体外周血标本,用Genomic DNA purification kit (Promega 公司)提取基因组DNA ,保
存于-20°C 备用。
2 .PCR 扩增
采用不对称PCR 扩增以产生单链的靶片段,正向引物(5’- gag aca gct gtt gaa cct aag -3’ )与荧
光标记反向引物(5’- aga cat cta ttt cat aca ggt atc-3’ )(ACCESSION NO :U59249 )的比例优化为1:10。
PCR 扩增条件为:预变性94°C 5 min ;变性94°C 30 sec ,退火58°C 30 sec ,延伸72°C30 sec ,共30
循环;最后72°C 延伸5 min 。PCR 产物用2% 的琼脂糖凝胶电泳分析。
3 .寡核苷酸芯片制备
- 104 -
本实验针对瘦素受体第 109 位氨基酸相应的核苷酸突变位点设计相应检测探针并进行优化,使
突变位点产生最佳杂交信号。其优化探针序列为 tgaaggaaggacatttgt 、tgaaggaaggacatttgt 、
tgaaggaacgacatttgt 和tgaaggaatgacatttgt 。待检测的多态性核苷酸位点位于探针序列的中间(阴影字体
表示)。将探针用注射用水稀释至终浓度为100µmol/L,并取5µL 与点样液(5×SSC,0.1%SDS ,1%Ficoll
和5%甘油)等量混匀,转移至96 孔板。用芯片点样仪(Cartisan )点至醛基化玻片上,每点体积约
为0.5nL ,点心间距为500µm,点直径约为200µm ,每条探针重复点2 次。点样时保持湿度90%,
温度23°C 。经点样的芯片在使用前于室温放置至少24h 。
4 .芯片杂交、洗涤与扫描
将Cy3-标记的不对称PCR 产物4µL 与杂交液(5×SSC, 0.1%SDS, 1×Denhart 试剂,0.1µg/µL 鲑
精 DNA )6µL 混合,将 10µL 混合液转移至芯片的杂交区域。芯片置于杂交盒中在42°C 水浴中保
温1 小时。杂交后芯片依次在洗液A (1×SSC, 0.2% SDS),B (0.2×SSC )和C (0.1×SSC )中各洗涤
1 分钟。待干后芯片用激光共聚焦扫描仪GenePix 4000 (Axon Instrument )在激发波长540nm、发射
波长570nm
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