远程寄生虫卵图像计量分析工具的开发.pdfVIP

远程寄生虫卵图像计量分析工具的开发 ① ＊ ② ① ① ① 刘治远 刘燕 张晓东 詹时兆 李日辉 方子豪 基金项目：国家科技重大专项项目资助（编号：2008ZX10004-011） ＊通讯作者：中山大学中山医学院，510080，广东省广州市中山二路74 号 ①中山大学中山医学院，510080，广东省广州市中山二路74 号 ②中山大学附属第三医院信息科，510630，广东省广州市天河区天河路600 号 摘 要 为了充分实现远程寄生虫卵显微镜图像分析的技术，本文开发了一套用于远程寄生虫卵图 像计量分析的软件工具。它在原有的虫卵自动分割技术上加入了自动测量寄生虫卵显微镜图像大 小、形状和卵壳厚度的计量分析功能，并嵌入到“病原体远程监测网站”上。为医生以及研究工作 者提供了辅助定量分析的工具，使得鉴别显微镜样本图片中寄生虫卵的工作变得简单高效。同时本 文采用一种无刷新的网站实现方案，在保证用户的良好体验的前提下，满足系统初期保存用户上传 样本图片的需求。 关键词 量化分析 寄生虫虫卵图像 网页应用 ajax 技术 1 引言 为满足广大临床、研究工作的需要，实验室的分析计算工具以及知识数据库被广泛发布到网络 上对外进行公开服务。利用这些免费的应用和数据库，研究工作者可以快速分析已有数据的特征。 寄生虫卵的形态特征是诊断识别粪便样本中寄生虫卵显微镜图像的常用特征。根据显微镜下寄 生虫卵的大小、形状、颜色、卵壳厚度、边缘特征（横纹线、卵盖、卵盖清晰度、塞状物等）以及 虫卵内容物可以分辨出该虫卵属于哪种类型和生长期中的哪个阶段。传统的寄生虫学科临床、研究 工作都是由医生或者研究者在光学显微镜下根据各个虫卵的形态特征进行鉴别，在众多的寄生虫样 本中对不同的虫卵进行鉴别是一项既繁琐又极耗精力的工作。但由于它是寄生虫病卫生防疫、临床 治疗和寄生虫学科研究的首要初始环节，所以医学工作者希望能高效、准确地识别出待分析样本的 寄生虫卵。为此，有必要依据寄生虫虫卵图谱，结合机器视觉、计算机图像分析技术和网络技术， 开发一套用于检测寄生虫虫卵的辅助测量分析计算机软件工具，进而实现用自动智能化的操作替代 简单繁琐的机械看图测量操作，提高寄生虫卵识别的效率；并将其制作成网络应用发布在网上对外 [1] 服务 ，实现辅助边远以及基层地区的医务工作者进行寄生虫卵的鉴别工作。 2 虫卵普通特征计算方法 在研究项目中，我们将寄生虫虫卵特征分为普通特征和抽象特征两大类。普通特征是指借助显 微镜从视觉上可观察到的形态特征。它们包括了寄生虫虫卵的大小、形状、颜色、卵壳厚度、边缘 特征（横纹线、卵盖、卵盖清晰度、塞状物等）。但对于缺乏经验的医生和研究者在带有极大噪声 的粪便样本中容易准确识别出虫卵，往往造成误诊或者漏诊。针对寄生虫卵的形态学特征，再考虑 到粪便样本的特点，利用计算机图像、图形分割和测量技术，开发出易于使用的定量测量虫卵工具。 2.1 虫卵大小的测量 各种虫卵的大小差异很大，同种虫卵的大小也有差异，衡量虫卵大小使用的 [2] 是虫卵的长径值 。由于大多数虫卵不是严格意义上的轴对称图形，所以本文寻求虫卵边界相对方 向上的最远距离作为虫卵的长径。 [3] 测量虫卵的大小首先通过“虫卵的级联自动分割法” 精确确定待测虫卵边界，然后在虫卵边 界点集中计算相对方向的最远距离即为该虫卵的长径值。假设计算的虫卵边界点集有N 个点，在边 2 界点集中任意选择两点计算其距离，得到 个距离值的结果集合，最后在结果集中选择最大值即为 C n 最终虫卵的长径值。具体算法如下：对虫卵进行自动分割，获取虫卵边界点集U；在点集U 中任意 2 n 选择两点A 和B 计算其距离，并放入结果集R 中，共有 个值，其中 为点集U 中点的个数；求集 C