16SrRNA序列分析与其在乳酸菌分类_鉴定中的应用_赵玉娟.pdfVIP

※专题论述 食品科学 2009, Vol. 30, No. 07 299 16S rRNA 序列分析及其在乳酸菌 分类、鉴定中的应用 赵玉娟，牛春华，张 雪，李 达，张 健，杨贞耐* (吉林省农业科学院农产品加工中心，吉林长春 130124) 摘 要：综述16S rRNA 的特点及序列分析的基本方法，并详细介绍了几种在乳酸菌分类和鉴定中较常用的16S rRNA 相关的分子生物学方法，如16S rRNA 直接测序、寡核苷酸探针、限制性片段长度多态性分析、温度梯度凝胶电 泳等，以及这些方法的研究进展。 关键词：乳酸菌；16S r RNA ；分类；鉴定 Sequence Analysis of 16S rRNA and Its Application in Classification and Identification of Lactic Acid Bacteria ZHAO Yu -j uan ，NIU Chun-hua ，ZHANG Xue ，LI Da ，ZHANG Jian ，YANG Zhen-nai * (Center of Agro-Food Technology, Jilin Academy of Agricultural Sciences, Changchun 130124, China) Abstract ：The characteristics of 16S rRNA and the fundamental methodology of its sequence analysis were reviewed in this paper. Several molecular biological methods related to 16S rRNA sequence analysis were detailed to classify and identify lactic acid bacteria such as direct sequencing, oligonucleotide probes, the polymorphism of restriction fragment length, temperature gradient gel electrophoresis. The recent progresses in the application of these methods were also introduced in detail. Key words ：lactic acid bacteria ；16S rRNA ；classification ；identification 中图分类号：Q939.1 文献标识码：A 文章编号：1002-6630(2009)07-0299-05 人类对乳酸菌的认识和利用已经有久远的历史，并 法对生物进行分类，他通过比较各类生物细胞的r RNA 积累了丰富的经验和知识。多年来，对乳酸菌的分类、 特征序列，认为16S rRNA 及16S rDNA 基因序列作为 鉴定一直沿用传统的方法，包括形态特征、生理生化 生物系统发育指标最为合适，其主要依据为：( 1) 1 6 S 反应及血清学反应等。这种方法存在很多缺点，如实 r R N A 功能同源且最为古老，素有 “细菌石”之称； 验周期长，由于人工环境与原生境的偏差很难分离出样 (2 ) 16S r R NA 为细胞所共有，并参与生物蛋白质的合 品中全部的微生物，对大多数乳酸菌不能进行分型或鉴 成；(3) 16S rRNA 既含有保守序列，又有中度保守和高 定到亚种，实验结果依赖人的主观判断等。 度变化的序列区域；(4 ) 16S rRNA 相对分子质量大小适 近年来逐步建立起来的