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• 专栏：中药资源学研究•
药用植物DNA 条形码鉴定策略及关键技术分析
1* 1 1 1 2 1
陈士林 宋经元 姚 辉 石林春 罗 焜 韩建萍
, , , , ,
1 中国医学科学院药用植物研究所 北京
, 100193;
2 湖北中医学院药学院 武汉
, 430061
【摘 要】 DNA 条形码(DNA barcoding)是近年来生物分类和鉴定的研究热点和方向, 其在药用植物鉴定中的
成功应用将可能是生药鉴定方法的革命性突破。本文结合具体研究工作就构建药用植物 DNA 条形码鉴定平台的标
准化流程、药用植物 DNA 条形码鉴定序列的选择、DNA 条形码序列校对机制、DNA 条形码序列鉴定效率评价方
, DNA
法进行了探讨 并展望了 条形码的发展趋势。
【关键词】 药用植物; DNA 条形码; 鉴定; 标准化
【中图分类号】 R282 【文献标识号】 A 【文章编号】1672-3651(2009)05-0322-06
doi: 10.3724/SP. J. 1009.2009.00322
DNA 条形码是 2003 年由加拿大动物学家
Hebert 首次提出[1,2], 它是利用基因组中一段公认 1 药用植物 DNA 条形码鉴定序列的选择
的标准短序列来进行物种鉴定的分子诊断新技术。 1.1 DNA 条形码鉴定序列筛选
Gregory 认为全球性的DNA 条形码创新研究将成为 自Hebert 提出以线粒体细胞色素c 氧化酶亚基
继人类基因组计划后的大科学计划(‘big science’ I(COI)作为条形码对动物进行鉴定后[1, 2], 在筛选
programme)[3], Miller 于PNAS 上发表了“DNA 条 适合作为植物标准 DNA 条形码的研究中, 研究者
[4] DNA
形码与分类学的文艺复兴” 。 条形码已成为 提出了10 多条DNA 条形码候选序列以及不同的序
全球生物分类学的研究热点和方向, 在 Nature , 列组合：nr ITS 和psbA-trnH [11]; rbcL[12]; rpoC1, rpoB
Science 等学术刊物和National Geographic News 、 和matK 或rpoC1, matK 和psbA-trnH [13]; psbA-trnH
The New York Times 等媒体上大量报道。DNA 条形 和rbcL[14]; matK, atpF-atpH 和psbA-trnH 或matK,
[15]
码技术在药用植物鉴定中的成功应用将是中药鉴 atpF-atpH 和 psbK-psbI (Ki-Joong Kim 提出) ;
定方法的革命性突破, 目前陈士林等主要依据《中 trnL(UAA)[16]; matK[17], 但对植物DNA 条形码序
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