TaqMan-LNA探针荧光定量PCR快速检测对虾传染性皮下与造血组织坏死病毒.pdfVIP

TaqMan-LNA探针荧光定量PCR快速检测对虾传染性皮下与造血组织坏死病毒.pdf

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南方农业学报 2011,42(12):1545~1549 JournalofSouthern Agriculture http://www.nfnyxb.com TaqMan—LNA探针荧光定量PCR快速检测对虾 传染性皮下及造血组织坏死病毒 韦信贤,一,童桂香 ,谢宗升 ,吴祥庆 ,黄国秋 ·,黄玉柳 ,廖永志 ,黎小正 (广西渔业病害防治环境监测和质量检验中心,南宁 530021; 上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306) 摘要:【目的】建立快速、特异、灵敏检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)的TaqMan—LNA探针荧光 定量PCR方法,为IHHNV的临床诊断和疫情监测提供更简便的检测技术。【方法】根据GenBank已发表的IHHNV毒株序 列,在IHHNV保守区序列设计特异性引物和TaqMan—LNA探针;对荧光定量PCR反应条件进行优化以缩短检测时间, 提高特异性和灵敏度;应用TaqMan—LNA探针荧光定量PCR对广西地区的300份凡纳滨对虾样品进行检测 ,验证方法 的实用性。【结果 】TaqMan—LNA探针荧光定量PCR检~j[lHHNV的灵敏度高,约为10个病毒粒子,反应 ,定量范围宽,在 1.6x10 1.6×l0s拷贝/L的范围内具良好的线性关系;与SPF凡纳滨对虾组织、WSSV、副溶血弧菌的DNA和rI1sv的RNA 均无反应,特异性好;组内变异系数为0.53%一1.75%,组间变异系数为0.81%~1.14%,重复性和重现性均较好 ,结果稳 定可靠;临床应用结果表明,300份凡纳滨对虾样品检出193份阳性,阳性率为64.3%,表明广西沿海地区养殖的凡纳滨 对虾IHHNV感染率较高。【结论】利用TaqMan—LNA探针建立检~JtIHHNV的荧光定量PCR方法具有快速、特异、灵敏、重 复性好、能定量等优点,可用于对虾IHHNV的检测。 关键词:凡纳滨对虾 ;传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV);TaqMan—LNA探针;荧光定量PCR 中图分类号:$945.4 文献标志码:A 文章编号:2095—1191(2011)12—1545—05 Rapiddetectionofinfectioushypodermalandhematopoietic necrosisvirusinshrimpsusingTaqMan-LNA probe real-timePCR WEIXin—xian,一,TONGGui—xiang ,XIEZong-sheng ,WUXiang-qing , HUANGGuo—qiu ,HUANGYu-liu ,LIAOYong-zhi,LIXiao-zheng (FisheriesDiseasePreventionEnvironmentalMonitoringandQualityTestingCenterofGuangxi,Nanning530021,China; CollegeofFisheriesandLifeScience,ShanghaiOceanUniversity,Shanghai201306,China) Abstract:【Objective】ThepresentexperimentwasconductedtodevelopaTaqMan-LNAprobereal-timePCRassay fordetectionofinfeetioushypodermalandhematopoieticnecrosesvirusfIHHNV)toprovideconvenientdetectiontechnology ofrclinicaldiagnosisandepidemicmonitoringofIHHNV.【Method】rI1IlespecificprimersandTaqMan-LNA probes w

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