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草原红牛群体中微卫星DNA多态性的研究.pdf
维普资讯
动物医学进展 .2004,25(5):I10—113
ProgressinVeterinaryM edicine
草原红牛群体中微卫星DNA 多态性的研究
杨 国忠 ,任文陟 ,张嘉保 ,赵玉民。,胡成华。,张国梁。
(1.河北北方学院牧工系,河北张家口075131;2.中国人民解放军军需大学军事兽医系,吉林长春 130062}
3.吉林省农科院畜牧分院,吉林公主岭 136100)
中圈分类号 :$823.8~Q523 文献标识码:A 文章螭号:1007—5038(2004)05—0110—04
摘 要 :选用草原红牛42头作为试验牛群体 ,经 酶 K、RNAase、Tris饱 和酚、Tris、EDTA、DNAMark-
过牛血液基 因组 DNA 的提取 、8对微卫星引物 er,N、N 一亚 甲双丙烯酰胺、TEMED、尿素、过硫酸铵、
的PCR扩增、扩增产物的聚丙烯酰胺 电泳分型、丙烯酰胺、硝酸银、亲水硅烷、疏水硅烷、引物等。
1I1_3 主要仪器 PCR仪、高速冷冻离心机、核酸测
UVmAND计算机凝胶成像分析 系统分析各位
序电泳仪、电泳仪、紫外透射反射分析仪、电子天平等。
点等 位 基 因及 全 部 个 体 的标 记 基 因型、
1.2 方 法
PPAP3.0软件计 算基 因频率、多态信 息含量
1I2.1基因组DNA的提取参照 《分子克隆实验指南 。
(PIC)和杂合度等步骤 ,从分子水平上分析 了草 1.2.2 引物的筛选与合成 参考国内外相关研究结
原红牛在 8个位点的遗传多态性。结果表 明,果,选出5条染色体上的8个与某些牛种生产性能相关
ETH225、IDVGA2、IDVGA46和 IDVGA44等 的微卫星位点。自牛的微卫星数据库 ,查出相应的微卫
位基 因数分别为 5、4、3和 4,多态信 息含量分别 星引物序列,引物由北京鼎国生物技术发展中心和赛百
为 0.5420,0.6736,0.5218和 O.575O,这 4个 胜生物技术公司合成。8个微卫星位点的引物序列及
位点为高度多态位点。而另 4个位点BM2113、PCR扩增反应条件见表 1。
1_2.3 PCR扩增程序:94℃预变性 5min--~94℃变性
BM1824、IDVGA55和 TGLA44等位基 因数分
3Os一退火 45s一72℃延伸 45S,再反复进行 35个循
另q2、2、2和 5,多态信 息含量分别为 0.3698,
环后 72℃延伸 10min。
0.3604,0.3538和 0.4708,属于中度多态性位 1I2.4 PCR产物的检测及 电泳分型 扩增产物先在
点。8个位点作为遗传标记应用于草原红牛遗 15g/L琼脂糖凝胶上电泳,并以核酸分子量标准作对
传育种研 究之 中是可行的。 照,在紫外透射分析仪上观察是否有所需的条带,若有
关键词:草原红牛;微卫星DNA;遗传多态性 继续转到 8 变性聚丙烯酰胺凝胶胶上电泳分型。采
近年来,随着现代分子生物学技术的发展,一些高 用银染法经过固定 漂洗、染色、显影、终止及清洗等步
效的分子遗传标记将各种畜禽的遗传图谱研究推向深 骤进行染色,便得到凝胶图。拍照保存 以判定基因型。
入,为将复杂的数量性状分解为多个数量性状基因座进 1.2.5 基因型的判定 用凝胶成像系统携带的UVI_
行定位分析,提供了研究单个基因特性的手段,为动物 BANDVersion99软件中的Mw—RF功能分析计算全
育种从数量性状的表型操作深入到基
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