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物理化学学报(Wuli Huaxue Xuebao)
July 6 Acta Phys. -Chim. Sin., 2009, 25(7)：1259-126 1259
[Article]
毒蕈碱型M1 受体的同源模建和分子对接
吕 雯 吕 炜 牛 彦 雷小平*
(北京大学药学院药物化学系, 北京 100083)
摘要： 采用同源模建方法对M1 受体的三维结构进行了模拟, 将得到的模型分别与M 受体完全激动剂乙酰胆
碱和M1 受体选择性激动剂占诺美林进行分子对接, 形成非特异性激动和特异性激动的受体-配体复合物. 用分
子动力学模拟方法分别将未与小分子对接的M1 受体、M1 受体- 乙酰胆碱复合物、M1 受体- 占诺美林复合物置于
磷脂双膜中模拟10 ns. 将模拟后的蛋白质结构与包含活性分子的测试库对接并将结果打分, 以top5% 富集因子
(EF)作为评价依据, 用占诺美林优化后的M 受体模型的EF为8.0, 用乙酰胆碱优化后M 受体模型的EF为6.5, 非复
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合物的EF 为1.5. 说明M1 受体选择性激动剂复合物进行分子动力学模拟后得到的三维结构模型比较合
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