线粒体基因片段在梭子蟹系统发育和物种鉴定中的应用.pdfVIP

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2017-08-07 发布于安徽
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线粒体基因片段在梭子蟹系统发育和物种鉴定中的应用.pdf

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1, 2 1, 2 2 2 3 1 张姝 , 李喜莲 , 崔朝霞 , 王鸿霞 , 王春琳 , 刘小林 ( 1. , 712100; 2. , 266071; 3. , 315211) : 测定三疣梭子蟹(P ortunus tritubercul atus) 9 个个体COI 基因部分序列467 b , 7 个个体16S rR NA 基因部分序列519 b , 同时测定样品蟹 1 个个体COI 基因部分序列468 b 结合GenBank 中收集的梭子蟹科 COI , 16S rR NA 两个基因所有同源序列信 ,使用 Kimura 双参数模型采用邻接法( NJ) 最大简约法( M P) 构建梭子蟹科分子系统发育树; 将样品蟹测得的COI 基因序列和已知属的其他蟹同源序列(429 b ) 进行比对分析结果分析表明: 两个基因片段序列平均碱基 AT 数量分数都明显高于 GC 数量分数; 梭子蟹属与美青蟹属关系最近, 属应为区别于梭子蟹属美青蟹属青蟹属的另一支, 支持属应划分在短桨蟹亚科的观点; 根据遗传距离以及转换/ 颠换( R) 值分析, 判定出样品为锐齿本试验运用线粒体基因片段探讨了梭子蟹类的系统发育关系以及样品蟹的种类鉴定, 为线粒体基因片段在梭子蟹的物种鉴定和系统发育重建中的开发和利用提供重要参考 : 线粒体基因; 梭子蟹; 系统发育; 分子分类 : Q178; Q953 :A : 2008) DNA( mtDNA) , , , DN A , , , , , , , , , , [ 1~ 5] 5 35 300 , , 60 , , , , , , COI, 16S rRNA , , , COI DNA , , 1 材料与方法 16S rRNA , COI COI 12S 1. 1 试验材料 rRNA , 16S rRNA , 1. 4%/ Ma[ 6] , , ( Portunus trituberculatus) ( Barcode) ( DD) ( YK) [ 7~ 9] [ 10~ 13] ( LZ) ( QD) ( ZJ) , [ 14] COI S cy lla p aramamosian : : COI : ( ; 16S rRNA ( 2006AA 10A406) [ 15, 16] , : ( 1982) , , , , [ 17] ,