基因表达数据聚类分析技术与其软件工具.pdfVIP

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2015-07-20 发布于安徽
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基因表达数据聚类分析技术与其软件工具.pdf

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8 2 V o l18 N o12 2 0 1 0 6 Ch ina Journa l o f B io inform at ics Jun. , 20 10 ( , 833200) : 随着 DNA 芯片技术的广泛应用, 基因表达数据分析已成为生命科学的研究热点之概述基因表达聚类技术类型算法分类与特点结果可视化与注释阐述些流行的和新型的算法介绍 17 个最新相关软件包和在线w eb 服务工具并说明软件工具的研究趋向 : 聚类基因表达数据簇可视化注释软件工具 : TP39, Q 78 : A : 167 2 - 5565 ( 20 10) - 02 - 104 - 06 C lustering analysis techno logy for m icroarray gen e expression data and its software tools OUYANG Y u-m ei (Departm ent of L iberalA rts Science, YiliN ormal University, K uitun X inj iang 33200, China) A bstrac t: A long w ith the research and ex tens ive applica tions of DNA m icroarray techno logy, g ene expression data ana lysis h as becom e a hotspot in life sc ience f ie ld. T his p ap er f irst summ arized techniqu e types for clu ster ing g ene expression data, c lassif ica tion and ch ar- ac ter o f a lgor ithm s, and clu ster v isu a lization and annotation. Second, it illu strated p arad igm s o f som e fash ionab le and new typ e a lgo- rithm s. Then, it introdu ced 17 latest so ftw a re packages and online w eb serv ices th at re late to c lu ste ring ana lysis o f gene expression da- ta. A t last, it d iscu ssed the deve lopm ent trends in this f ie ld. K ey W ords: c lu ste ring gene expression data clu ster v isu alization annota tion so ftw a re too ls ( DNA m icroarray ) , , , , , , , ,