转录组学技术在水产动物研究中运用.pdfVIP

第 卷第 期 水 产 学 报 年 月 文章编号 综述 转录组学技术在水产动物研究中的运用 罗 辉 叶 华 肖世俊 郑曙明 王晓清 王志勇 湖南农业大学动物科学技术学院湖南省水产高效健康生产协同创新中心湖南 长沙 西南大学鱼类繁育与健康养殖研究中心重庆 集美大学水产学院农业部东海海水健康养殖重点实验室福建 厦门 摘要 近年来转录组学技术及其在水产动物中的研究备受研究者的广泛关注 转录组学技 术主要有基于杂交技术和测序技术为基础的两大类技术两类技术在水产动物的转录组学研 究中均得到了广泛运用 尤其是二代测序技术的出现使得水产动物的转录组学研究达到了前 所未有的热度 本实验综述了近年来水产动物在免疫应答生长发育生物进化和毒理学方面 的转录组学研究进展 在综述已有成果的基础上分析了转录组学技术自身存在的局限性和 现阶段转录组学在水产动物研究中面临的问题与挑战并对未来水产动物转录组学研究趋势 进行了展望 关键词 水产动物 转录组学 基因表达 生物信息学 中图分类号 文献标志码 近年来转录组学基因组学和蛋白质组学等 变剪切反义转录本基因结构新基因差异表达 各种组学技术在揭示水产动物抗病免疫生长发 基因和单核苷酸多态性等 即使所研究的物种没 育系统进化和生物毒理过程及相应机理方面的 有现成的基因组信息可供参考同样可以进行 研究中越来越重要 通过组学研究可以深刻理 测序研究将所得序列信息通过 组 解水产动物各种生命活动规律的内在联系和分子 装拼接得到该物种的单一基因序列集数据 进 机制并根据相应结果进一步运用到抗病育种药 一步可以对基因进行功能注释基因差异表达分 物筛选种质资源保护和环境监测等多个研究领 析 富集分析 富集分析蛋白互作网 域 在各种组学技术中转录组学技术是伴随着 络分析和单核苷酸多态性分析等 转录组 后基因组学的到来而率先发展起来并得到广泛应 的复杂性必然要求有相应高通量的转录组学技术 作为研究工具 用的科学 转录组学是研究特定细胞组织或 器官在特定生长发育阶段或某种生理状况下所有 依据转录组学技术原理的不同可以将其划 转录本的科学 这所有的转录本就称之为转 分为两类技术 图 一种是基于杂交的转录 录组包括编码蛋白质的 和非编码 组学 技 术 如 利 用 微 阵 列 和其他 与基因组相对 和 宏阵列 进 稳定不同的是转录组是随着生长发育阶段生理 行检测的转录组学技术一种是基于测序的转录 状态和外界环境的改变而变化的 因此转录组 组学技 术 如 文 库 或 表 达 序 列 标 签 分析成为研究生物生长发育应激生理抗病免疫