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合成生物学与人工生命体 ● 叶邦策 王建军 计算机出问题不能工作了，通常我们会选择重装 是工程化设计。 操作系统。而类似的想法在活的细胞中也能够实现。这 传统生物学研究的目的就是了解各种有机生物 体。为了减少复杂性，人们往往把它们分解成各个部 是怎么回事呢?2007年10月6日，基因组研究先锋美 Venter 分。比如生物分子、信号通路、细胞等，然后在特定的条 国克雷格·文特尔研究所(J．CraigInstitute)已 件下进行研究。通过这种思路，生物学家们发现了基因 成功地合成了生殖支原体(Mycoplasmagenitalium)的 基因组。2008年1月24日出版的美国《科学》(Sci—组、蛋白质、生物体的种种性质以及相互之间的作用机 制。在大规模基因组测序和各种组学研究的推动下，系 ellce)周刊网络版对此进行了报道。此前研究所的科学 统生物学试图将过去孤立的成分综合起来，进而去理 家曾将蕈状支原体(Mycoplasmamycoides)的基因组移 植到与之关系密切的山羊支原体(Mycoplasmacapri— 解细胞的整体行为。 colum)内．而且新植入的基因组开始取代原基因组运 人们研究生物体的各种天然性质，不少发现已得 作。《科学》周刊评论说，虽然现在还不能证实合成的基 以应用。在这方面生物学一直遵循应用、修改、提高天 因组是否可以是真正代替自然状态下的基因组，但是 然系统的规则来产生新的应用知识。所有这些成功都 这项工作已经为定制细菌使其更有效地生成药物、生 依赖于生物世界巨大的多样性。但是这个多样性亦限 物油料和其他对人类有用的分子铺平了道路，并认为 制了人们理性设计和预测生物系统的能力。与传统生 这是“生物工程领域的里程碑”。这些研究成果是新兴 物学通过解剖生命体以研究其内在构造的办法不同的 的合成生物学领域所取得的杰出成就。 是。合成生物学的研究方向完全相反，它是从最基本的 要素开始一步步建立零部件，以一些特性良好的通用 合成生物学的基本理念 部件为起点，这些通用部件简单、稳定，要么由天然成 合成生物学是以工程学理论为指导。设计和合成 分衍变过来．要么就是完全人工设计。 各种复杂生物功能模块、系统甚至人工生命体，并应用 与基因工程把一个物种的基因延续、改变并转移至 于特定化学物生产、生物材料制造、基因治疗、组织工 另一物种的作法不同．合成生物学的最终目标是组装基 程等的一门综合学科。它涉及微生物学、分子生物学、 本生物部件。设计性质可预测的有用生物系统，并不断 系统生物学、遗传学、材料科学以及计算机科学等多个 提高其复杂性。让它们像电路一样运行。设计复杂生物 学科。合成生物学代表了生物系统设计的新趋势，其诞 系统是合成生物学的中心法则，这需要完全理解各个部 生可以追溯到20世纪六七十年代出现的多种技术和 件以及它们之间的相互作用，这也提供了修改部件和可 靠预测系统行为的机会。合成生物学亦与机械工程有相 认识，包括基因电路(geneticcircuit)的研究、基因转录 的蛋白调控以及DNA重组技术等。合成生物学的最终 似性。标准化的机械零部件，经过大小、形状、材料的改 形成主要依赖于四个方面的突破：一是低成本、高通量