细菌的蛋白质组学的研究进展.pdfVIP

346 国外医学临床生物化学与检验学分册　2002 年第 23 卷第 6 期 　综　述　 细菌的蛋白质组学研究进展 罗 　强 综述 　王 　跃 审校 (重庆医科大学医学检验系临床微生物教研室 ,重庆 400016) 　　摘 　要 :随着“人类基因组计划”的完成 ,包括双向电泳和质谱技术的蛋白质组学逐渐成为了医学研究的中心。细菌作为医学 研究的对象和工具 ,其蛋白质组的研究是对其基因组的补充 ,对人类蛋白质组的前瞻。研究主要集中在新蛋白的发现、蛋白质间 的修饰、蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用等方面 ,为新抗生素靶位的发现、新替代疫苗的研制、致病机制及耐药机制的研究 提供了依据。本文就细菌蛋白质组研究进展作一简要的概述。 关键词 :蛋白质组学 ;细菌 ;蛋白质修饰 ;蛋白质组比较 ;蛋白质相互作用 中图分类号:R446 5 文献标识码 :A 文章编号 :(2002) ( ) 　　蛋白质组学 Proteomics 是合并双向电泳分离和质谱分析 因组中的 Rd 基因所表达的外脂蛋白 P6 是一个理论推断出的 技术 ,并应用生物信息学阐明生物体全部蛋白质的表达模式和 替代疫苗的主要成份 ,为新疫苗的发现奠定了基础。在其中它 功能模式的一个研究领域。它包括了对蛋白质的存在方式、翻 们也是应用蛋白质组学的方法来补充基因组学研究的成果、快 译后修饰形式的鉴定及对蛋白质的结构、功能和相互作用的研 速鉴定基因产物而实现的。 究。自从 1994 年 Wilkins MR 和 Williams KL 第一次提出“蛋 112 　细菌耐药性的研究 　细菌的耐药性一直是临床上很棘 白质组学”这个概念以来,在这方面的研究已经成为了医学领 手的一个问题 ,但随着人和细菌基因序列的逐渐清楚 ,大量的 域研究的前沿。随着“人类基因组计划”的即将完成 ,后基因时 数据和信息被提供 ,就为发现新的药物作用靶位创造了条件。 代的到来 , 已有人提出了一个“人类蛋白质组计划”的方案 ,但 细胞内蛋白质功能及其相互关系的清楚和细胞循环蛋白的相 这将是一个非常巨大、复杂的工程 ,蛋白质组不仅在每一个人 互作用图的绘制成功为细菌耐药性的解决、新药的发现提供了 之间不同 ,在同一个人不同时期也有变化。为了能顺利地过渡 信息和途径。 [ 4 ] ( ) ( ) 到对人蛋白质组的研究上 ,对那些已经比较熟悉、易培养、好控 Mcatee CD 等 在幽门螺杆菌 HP 对甲硝唑 M TZ 耐药 制的细菌进行研究就显得尤为重要 ,并且由于许多细菌的基因 性的研究中 ,对差别调控蛋白的蛋白质组学技术的应用就为克 组序列的测定已经完成 ,而且基因数量少 , 因此对细菌产生的 服 M TZ 的耐药进行了深入的分析。对因 rdxA 基因突变引起 蛋白质的鉴定就更简单了。 中度耐 M TZ 的26695 株 HP 增殖、裂解后进行蛋白质组分析 , 细菌作为研究的对象和工具 ,对其蛋白质组的分析和鉴定 发现有几种蛋白质比正常细菌增加了一倍 ,并发现 AHP (一种 ) 也加快了蛋白质组学技术的进步。由于毛细管色谱和质谱的 存在于各种原核和真核系统中的氧中毒耐受相关的必需酶 的