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重庆医科大学
2010级硕士研究生《蛋白质组学》试题
姓名: 学号: 所在大班:
专业: 得分:
交卷时间:2010.1.10 交卷地点:东大楼810房间
交卷方式:各大班科代表收集并按学号顺序整理后上交
一、解释(共25分)
1、MALDI TOF MS(10分)
2、亚细胞蛋白质组学(5分)
3、免疫共沉淀(5分)
4、激光共聚焦扫描显微技术(5分)
二、 问答题(共75分)
1、简述2DE的原理及该技术的特点。/血清蛋白质组研究中需要着重注意的问题(11分)。
3、简述药物蛋白质组学定义及主要研究领域。试举例说明其在药物靶点的发现和确认中的应用(12分)。
4、将文献Proteome Analysis of Hepatocellular Carcinoma by Two-dimensional Difference Gel Electrophoresis(Fuchu He et al,Molecular Cellular Proteomics 6:1798-1808, 2007)中的ABSTRACT翻译成中文(10分)。
5、简述目前的蛋白质组学技术在医学研究中的优势和不足(12分)。
6、简述神经蛋白质组学研究标本的种类及其优缺点(10分)。
7、简述Laser capture microdissection (LCM) technology并举例说明其在蛋白组学研究中的应用价值(10分)。
MALDI TOF MS
即基质辅助激光解析离子化/飞行时间质谱,是近年来发展起来的一种新型的软电离生物质谱,仪器主要由两部分组成:基质激光电离离子源(MALDI)和飞行时间质量分析器(TOF)。MALDI的原理是因此它是一种软电离技术,适用于混合物及生物大分子的测定。TOF离子在。MALDI-TOF-MS,为生命科学等领域提供了一种强有力的分析测试手段,并正扮演着越来越重要的作用。Two-dimensional Gel Electrophoresis:
即双向凝胶电泳(2-DE),该技术是根据蛋白质的等电点和分子量的差异,连续进行垂直方向的两次电泳而将待测蛋白质进行分离。第一向为等电聚焦(IEF)电泳,其基本原理是利用蛋白质分子的等电点的不同进行蛋白质的分离。第二向为十二烷基硫酸钠一聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS—PAGE),其基本原理是利用蛋白质分子量大小的不同进行蛋白质分离,从而把复杂蛋白质混合物在二维平面上分开。该技术是目前蛋白质组学研究中分辨率最高,信息量最大的分离技术,是比较蛋白质组学研究中也是不可取少的手段。
药物蛋白质组学的主要研究领域有哪些?
答:药物蛋白质组学的主要研究领域包括:
1.药物作用靶点的蛋白质组学研究。药物蛋白质组学在蛋白质组学的基础上,通过系统地研究药物与细胞内蛋白质的相互作用,可以发现药物的作用靶点,并为新药的设计提供依据。
2.生物标志物的蛋白质组学研究。个体化药物治疗、药物基因组学和药物蛋白质组学都要求根据患者个体特有的生物学特征来设计药物治疗方案,而生物标志物在这一过程中起着重要的作用。生物标志物是可以定量测定的,与疾病发生、发展密切相关的各种细胞学,生物学、生物化学或分子指标,可以用作评价、诊断疾病、预后评价和药物治疗有效性评价的参数。
蛋白质组学的出现和发展,带来了双向电泳、多维色谱、蛋白芯片、生物质谱等一系列新技术,这些技术给临床肿瘤标志物的发现带来了突破性的进步,不仅一次能测定数百个蛋白标志物,而且大大提高了肿瘤诊断的灵敏度和特异性。又如通过药物蛋白质组学的相关技术,能对药物、化学物质与环境毒物的毒性进行评价。
3.抗肿瘤药物多耐药机制的蛋白质组学研究。由于蛋白质组学方法能够分析药物敏感与药物抵抗细胞中全部蛋白质变化,所以是研究多药耐药非常有用的工具。
4.药物治疗学中的蛋白质组学研究。
1)肿瘤细胞蛋白质组表达谱。由于多数临床生物标志物和药物靶点是蛋白质,所以蛋白质组表达谱可以更加直接着眼于现在的生物学与药理学问题,并对蛋白质表达水平进行量化,从而对药理学问题进行更多的直接解释。运用蛋白质组学技术平台,已从源自乳腺癌、宫颈癌等肿瘤细胞株中鉴定出一批肿瘤细胞蛋白质组表达谱。
2)基于蛋白质组表达谱的抗肿瘤药物化疗敏感性预测。美国国家癌症研究所(NCI)开展可NCI-60药物研究计划。NCI-60平台是以来源于9种不同组织的60个重要的人类肿瘤细胞株建立的肿瘤细胞平台。该平台代表了相应类型肿瘤的生物学特点,所以使用这些细胞株进行多种分析可获得重复性好且稳定的实验结果。目前,已有利用NCI-60平台开展研究工作的大量报道。有报道基于蛋白质组表达谱对化疗敏感性进行预测的结果是精确的,研究结果可用于未接受治
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