03章 物理化学方法.pptVIP

* * 第三章 生物无机化学中的 物理化学方法 物理化学方法在生物无机化学中具有举足轻重的作用，它们所提供的一系列重要线索为生物无机化学家绘制一幅完整的生物体系中金属离子的图画奠定了基础。所有的生物无机化学工作者都需要了解如何运用物理化学方法对各种金属－生物体系进行分析。 分子的各种运动具有不同的能级，从基态吸收特定能量的电磁波跃迁到高能级，可以得到对应的波谱。通过对所得到的谱图进行分析，即可得到分子的结构、组成等有关信息。 （8）红外光谱（9）拉曼光谱 (10) 磁性 生物无机化学研究中的重要仪器方法包括： （1）X射线单晶衍射法（2）X射线吸收光谱 （3）核磁共振谱 （4）质谱 （5）电子顺磁共振光谱（6）圆二色性谱 （7）紫外－可见光谱 （11）电化学分析方法（12）毛细管电泳技术 第一节 配位化学基础 第二节 X射线单晶衍射法 第一节 配位化学基础 生物体系中的金属离子主要以配合物形式存在，因此配位化学知识是生物无机化学研究的基础。配合物的组成、类型、结构、性质以及配位场理论等内容不可或缺。 一、配合物的组成和分类： 配合物 内界 外界 中心原子(离子) 配体 单齿配体 多齿配体 中心离子 配体 配位原子 配位数 配离子的电荷 螯合效应 简单配合物 螯合物 在生物无机化学中，金属主要采取配位数为3～6的几何构型。 二、配合物的几何构型 配合物的几何构型与配合物的配位数有关，配位数不同，配合物的几何构型也不同。 配位数 空间构型 2 直线 3 平面三角形 4 四面体、平面正方形 5 三角双锥、四方锥 6 八面体 7 五角双锥 配位数与配合物空间构型的关系 配位数3 配位数4 配位数5 配位数6 三、配位理论 价键理论 晶体场理论 配位理论 固态是物质的一种聚集态形式，一般可以分为晶态与非晶态两种状态。非晶态物质的分子或原子排列没有明显的规律。而晶态物质中，原子或分子的排列有明显的规律性。晶体(crystal)是一种原子有规律地重复排列的固体物质。 第二节 X射线单晶衍射法 1895年，伦琴发现X射线(X-ray) 20世纪初，德国科学家劳埃开始对晶体进行 研究，提出劳埃方程 1912年，布拉格提出布拉格方程，测定 NaCl和KCl晶体结构 X射线衍射方法用于研究生物大分子的结构开始于20世纪60年代。1957年，M. Perutz研究组确定了第一个肌红蛋白的三维晶体结构，因此获得了1962年的诺贝尔化学奖。 我国的生物大分子晶体学研究几乎同时起步，并于20世纪70年代初测定了猪胰岛素的空间结构。 当今仪器设计和软件技术的发展日趋完善，X射线衍射方法成为蛋白质、核酸等生物分子空间结构测定中最为重要的方法。 X射线晶体结构测定的精确度取决于数据的质量和分辨率。低分辨率条件下，通常只能分辨出整个分子的形态。在高分辨率条件下，可以完全分辨出原子的精确位置。 在晶体结构分析中应用的X射线是波长在0.1 nm左右的电磁波。由于这一波长与晶体内原子间的距离具有同一数量级，且晶体结构内分子排列的规则性，当X射线入射到晶体上时，晶体中的每一个原子都发射出次生的X射线，并相互干涉，形成衍射花样。 衍射花样内衍射点的排列方式、点间距离的大小与晶体内生物大分子的排列方式与重复周期大小有关，而衍射点的强度分布与生物大分子结构本身的特点有关。 因此，可以通过分析衍射点的排列方式和测量点间距离的大小来推算分子在晶体结构中的排列方式和重复周期的大小，以及通过测量衍射点的强度来测定分子内每个原子在空间的坐标，从而测定整个分子的结构和晶体结构。