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· l82· 抗感染药学，I疗，j，，归f，朋订mt!012september：9(3)
田美峥，等．基于结构的香农熵及其在金属阳勾酰胺5孽结构分析中的应用研究
11：23：48
网络出版时间：2012-8-1
DoI：10．3969／j．issn．1672—7878．2012．03—005
123．015．html
网络出版地址：h郇：／／www．cnkinet／1(cms／detail／32．1726．R1
基于结构的香农熵及其在金属p一内酰胺酶结构分析中的
． 应用研究”
周美峰”，乌兰，房咪，郑珩q
中国药科大学生命科学与技术学院，南京210009
【摘要】 目的：探讨金属B一内酰胺酶残基在结构上的变化程度。方法：对各亚类MBLs结构进行叠合，计算残
基间RMSD值，根据RMSD值差异引入基于结构的香农熵，并将基于结构的香农熵映射到lDD6结构上。结果：
结构上的变化主要集中在活性位点附近靠外的区域，而活性位点内部则相对变化较小。结论：在活性位点附近
100p区残基结构在不同MBLs中变化较大，是决定各亚类MBLs水解活性和特异性的主要因素。这一发现对于
指导计算机辅助MBLs抑制剂的设计有着重要的指导作用。
【关键词】金属p．内酰胺酶；香农熵；结构叠合；RMSD
【中图分类号】 R978．n 【文献标志码】A 【文章编号】 1672-7878(2012)03—0182一004
ofStructure·basedShanon inStructureof
Application Entropy Analysis
’ Metallo-p—lactamase★1
ZHoU Mi，ZHENGHengq
Mei·feng”，WULang，FANG
School Sciencennd Phdrmace“ticni 2j o009
ofL磅’e 1色chnology，China Universi毋，Nanjing
of baseinthestructure．
ABsTRACT thevariational
objective：1bstudy degreemetallo—p—lactamase(MBLs)residual
and
Methods：ThestllJcturesofdifkrcntsubclassofMBLswere the
mot·meat-squaredeviations(RMSD)
superposed
ofeachaminosjtewere tothedifrerencesofRMSD Shannon was
Value，stmcture_based
calculated．According entropy
torenectthe of
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