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大分子的形成 單糖、胺基酸、脂肪酸、氮基和維生素－為建構各式大分子和細胞胞器的元件－共有兩個可能來源 可以營養素的形式進入細胞，或是經由各式細胞代謝路徑合成 胺基酸、蛋白質合成與核酸合成 細胞大部分的構造都是由蛋白質組成，蛋白質也是酵素、細胞膜、細胞壁和細胞附器的重要組成成分 DNA和RNA是細胞延續遺傳特性和蛋白質合成方向的重要物質 醣類的生物合成 單糖，則是細菌細胞壁合成的重要物質 肽糖為含有壁酸 (muramic acid) 與葡萄糖胺 (glucosamine) 結合而成的聚合體 醣類 ( 去氧核糖、核酸 ) 也是核酸的必需建構單元 多醣體是細胞表面結構最主要的組成成分 本章重點4 “中間代謝”是指利用中間代謝化合物，將合成與分解反應連結起來的代謝路徑 雙向性化合物是位於中間代謝“交叉路”的化合物，它們不只參與分解代謝路徑，也是生物合成路徑的先驅分子 生物合成路徑所用的建構單元分子有兩個來源：環境和細胞自己的分解路徑。微生物利用ATP和其菌種的特殊化酵素，從這些單體建造大分子 蛋白質為所有細胞的必須大分子，因為它們的功用為構造組成物質、酵素和細胞附器 醣類可以做為能量來源、細胞壁組成物質及核?酸的組成成分 反應所形成的NADH，會送入電子傳遞鏈中，用以產生ATP；這是TCA 5次去氫反應的其中一次，也是有氧呼吸中較大的一次ATP輸出 乙醯基會被送入三羧酸循環，與四碳草醋酸 (oxaloacetate) 分子形成檸檬酸 TCA循環的步驟 三羧酸循環一共有8個步驟，由形成檸檬酸開始，至草醋酸 (oxaloacetic acid)結束 ( 圖8.21) (1) 每個受質和產物的碳數目 (#C)；(2) 產生 的反應；(3) 電子攜帶子NAD和FAD參與的反應；及 (4) 合成ATP的地點 TCA循環的反應： 草醋酸 (oxaloacetate; 4C)，與乙醯基輔酶的乙醯基 (2C) 反應，形成檸檬酸 (citrate; 6C)，並且釋放出輔酶A，使它可以其他乙醯基結合 檸檬酸轉化為其異構物，異檸檬酸 (isocitrate; 6C)，作為下一步脫羧和去氫作用的受質 異檸檬酸受到含NAD或NADP的酵素複合體的活化，產生NADH或NADPH，釋放出一個二氧化碳，及一個 ? 酮戊二酸 ? 酮戊二酸為再進行最後一次的脫羧反應，此為另一項輔酶A參與的氧化還原反應，產生NADH，以及一高能化合物，琥珀酸輔酶A (4C) 琥珀酸輔酶A是TCA循環中，受質層次磷酸化的一項來源 琥珀酸隨後進行脫水反應，此時電子和 的接受者是黃素腺嘌呤二核苷酸 (FAD)，催化酵素為琥珀去氫酶 (succinyl dehydrogenase)，位於細菌細胞膜和真核細胞粒線體的脊部 延胡索酸加入水分子 ( 稱為水合 )，產生蘋果酸 (malate; 4C) 蘋果酸脫水 ( 伴隨NADH形成 )，產生草醋酸 8.3.5　呼吸鏈：電子傳遞和氧化磷酸化反應 能量鏈，這是電子和氫最終的處理程序，即製造ATP的主要場所 電子傳遞系統 (ETS) 是由特殊的氧化還原攜帶子組成，它們能從糖解反應與TCA循環所產生的還原態攜帶子 (NADH, ) 獲得電子，並且以井然有序的方式連續傳遞 呼吸鏈所具有的高度區隔結構，對其功能相當重要，請看圖8.22，電子傳遞的攜帶子和酵素嵌入真核生物粒線體的內膜，細菌的相關結構則位於細胞膜上 電子傳遞鏈的組件：能量階梯 大部分好氧生物呼吸鏈電子攜帶子的順序為 (1) NADH去氫酶，它會與鄰近的攜帶子形成複合體；這些攜帶子為 (2) 單核苷酸黃素 (flavin mononucleotide, FMN)；(3) 輔酶Q；(4) 細胞色素b；(5) 細胞色素 ；(6) 細胞色素c；及 (7) 細胞色素a和a3，兩者結合成複合體 糖解作用與TCA循環產生之NADH，傳送至第1個攜帶子後，即啟動6個傳遞步驟，隨著一次又一次的氧化還原變化，還原物的能量將會逐漸降低。所釋放出來的能量，會由位於脊部、與ETS攜帶子緊密結合之ATP合成複合體獲得與利用。每1個進入電子傳遞鏈的NADH，會產生3個ATP ( 圖8.23) ATP的形成與化學滲透理論 電子傳遞的攜帶子在傳送電子時，會主動將氫離子 ( 質子 ) 打到粒線體的外部區間。這個過程會產生氫離子的濃度梯度，稱為質子動力 PMF會在外膜區間和內膜區間造成電荷差，前者帶正電荷，後者帶負電荷 ( 圖8.24) 氧化磷酸化的ATP產量 15個ATP ( 每電子對 ) 所以 ATPs，每個葡萄糖 2個ATP ( 每電子對 ) 所以 ATPs ( 每個葡萄糖 ) 8.3.6　有氧呼吸的總結 ATP的總產量為40：4個來自糖解作用，2個來自TCA循環，34個來自電子傳遞