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系统生物学的分析与建模.pdf
维普资讯
第33卷第4期 信息与控制 Vo1．33，No．4
2004年8月 InformationandControl Aug．，2OO4
文章编号：1002-0411(2004)04-0457-06
系统生物学的分析与建模
彭司华 ，周洪亮 ，彭小宁2，杜 维
(1．浙江大学-1-业控制技术国家重点实验室，浙江杭州 310027；
2．得克萨斯州立大学分子遗传学系MDAnderson癌症研究中心，休斯敦 TX77030，美国)
摘 要：要从系统水平上理解生物系统，必需建立一个新的框架．这个新的框架就是系统生物学，其 目的
在于在系统水平上阐述和理解生物系统．本文试图以系统控制学科的视点，评述系统生物学的分析与建模的
主要思路和方法，以及系统生物学发展现状和可能的发展前景．
关键词：系统生物学；非线性；复杂性；基因网络；蛋白质网络
中图分类号：TP11 文献标识码：A
AnalysisandModelingofSystemsBiology
PENG Si—hua 。ZHOU Hong—liang。PENGXiao—ning2。DU Wei
(1．DepartmentofControlScienceandEngineering-Zh4iangUn~rslty。Hangzhou 310027。Chn／a：
2．DepartmentofMolecularGenetics。kidAndersonCancerCenter。Univers ofTexas。Houston TX77030．USA)
Abstract：Tounderstandthelifesystem onsystematicallevel-anewframework-systemsbiology-mustbees·
tablished．whoseaimsaretodescribe andtounderstandlifesystem systematically．Intheviewpointofsystem and
controlscience，thispapertriestoreviewhteideasnadmehtodsofanalysisnadmodelinginsystemsbiology，nadto
discussitsrecentprogressnaditsforegroun ddirection．
Keywords：systems biology：nonlinearity：complexity：genenetworks：proteinnewtorks
1 引言 (Introduction) 物系统复杂性，也发表 了一些研究者所做的工
作 川 ．
8O年代在国际学术界兴起了研究非线性科学
然而，现代生物学无疑是以还原主义(Reduc—
的热潮，因为人们意识到非线性科学取得的成就昭
tionism)作为其方法论的．对于众多各种各样的生物
示了对世界本质的认识又跃进了一步．一个系统不
大分子的研究是现代生物学研究的基础，尤其是基
仅是其部分的总和，这意味着叠加原理的失效，在数
因学说和DNA双螺旋结构理论的提出，奠定了现代
学上说就是非线性．一切事
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