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布,根据所研究的问题构造检验统计量,按排列组合的原理导出检验统计量的理论抽样分布,
再求出从该分布中获得现有样本的概率(P 值),并界定此概率值,作出推论。RPT 方法属
于一种非参数方法,特别适用于复杂的、总体分布未知的样本数据的统计推断[9],下面介绍
两属性互信息关联度的 RPT 方法的具体步骤:
①建立假设,确定检验水平
H0 :I (X , X ) =0 ;H1::I (X , X ) ≠0 ;α=0.05 。
i j i j
②选择随机重排次数 M (如5000 次)。
③计算当前样本的互信息I (X , X ) 。
i j
④for k=1:M
对X i 、X j 进行随机重排得到X ik ,X j k ;
计算 k 次重排下的互信息I k (X ik , X jk ) ;
如此重复 M 次,共可得到 M 个重排样本后互信息 I 值。
⑤计算概率 P 值
在 H0 假设成立的前提下,P 值为“经验抽样分布” 中的互信息I 值大于等于当前样本的互
信息 I 值的概率,即:
P P ( I (X , X ) =≥ I (X , X ) ) number ( I (X , X ) =≥ I (X , X ) ) / M
k ik jk i j k ik jk i j
⑥根据小概率原理做出推断
通过 RPT 方法,可以得到互信息意义下的显著相关的属性组合,但是由于互信息无法
区分正相关与负相关,因此本文定义双阳率b ,即两属性同时出现的概率,通常情况下,当
b 大于 0 时即可排除负相关,由此定义正相关度量函数
1 sig(I (X ,X ))α 且 bθ ,
⎧
⎪ i j
ℜ(X , X ) ⎨
i j
0 其他
⎪
⎩
其中 sig(I (X , X )) 是互信息 I 通过 RPT 方法得到的显著值,α是 RPT 检验水平,θ是双
i j
阳率阈值。
2. 复杂网络的构建
以考察的相关属性为节点,正相关度量函数ℜ(X , X ) 为边,建立复杂网络,
i j
ℜ(X , X ) =1 ,则X i 与X 具有正相关关系,在复杂网络中表现为X i 与X 邻接。根据属
i j j j
性 X 的性质,可以将X 分为若干组,如中药组,中医证候组,症状组,病人基本信息组,
化疗方案组,疗效评估组等等,然后通过节点成组筛选可以建立相应的子网络,如药物配伍
网,“药-证” 网,“药-症” 网,“证-症” 网,对不同子网络的相关信息进行统计即可得到多维属
性之间的关联信息
1)网络的中心性研究
(
中心性研究是复杂网络研究的主要内容之一,网络中心性度量的指标有很多,包括节点
的中心度(Degree) 、接近度(Closeness) 、介数(Betweenness) 、信息(Information) 、特征向量
(Eigenvector)等,相对中心度(Relative Degree Centrality,RDC)可以描述并比较不同子网络的
节点重要性[10],定义相对中心度
C ( X ) C ( X ) / (n =− 1)
R d
其中 C ( X ) 是属性 X 的中心度,n 是属性个数。如对药物配伍子网络的中心性研究可
d
以帮助发现核心药物及相应的核心药对,对“症-证”子网络,“方-证”子网络,“药-症”子网络
的中心性研究可以发现核心证型,包括主要症状及其分布
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