鸽圆环病毒Cap基因的克隆与进化分析.pdfVIP

第 29卷 第 3期 金 陵 科 技 学 院 学 报 Vo1．29，No．3 2013年 9月 JOIⅡlNAI，OF ⅡNIING INSTIT 【兀EOFTECHNOLOGY Sep．，2013 鸽圆环病毒Cap基因的克隆与进化分析 张志成 ，张新晨，茅慧华，胡志华，戴鼎震 (金陵科技学院动物科学与技术学院，江苏 南京 210038) 摘 要 ：应用PCR方法对采集 的144份血清样 品进行鸽 圆环病毒 (Pigeoncircovirus，PiCV)检测 ，随机选择 6份 阳性样品进行Cap基因的扩增、纯化，并克隆至pMD18一T载体。测序结果与已知参考毒株进行序列比对和系统 进化分析 。结果显示：PiCV阳性检出率为75％(108／144)，说明PiCV的感染比较严重。自测的6株Cap基因核 苷酸 的同源性为 74．0％～100．0％，与GenBank上登录的国内外 14株 的Cap基因的核苷酸同源性为 72．1％～ i00．0 。通过进化树分析6株阳性样品分成两大分支：5株位于一大分支 ，亲缘关系较近；但HBLF株单独位于 另外一大分支，与其它5株亲缘关系远。 关键词 ：鸽 圆环病毒 ；PCR；Cap基 因扩增 ；系统进化分析 中图分类号 ：S836 文献标识码 ：A 文章编号 ：l672～755X(2013)03—0071～07 CloningandPhylogeneticAnalysisofCap GeneofPigeon Circovirus ZHANG Zhi～cheng，ZHANG Xin—chen，M AO Hui—hua，HU Zhi—hua，DAIDing—zhen (JinlingInstituteofTechnology，Nanjing210038，China) Abstract：Inthisstudy，pigeoncircovirus(PiCV)isdetectedfrom 144serum samplescollected from sixdifferentfarmsinChinabyPCR method．SixrandomlyselectedpositivePiCV samples areamplifiedforCapgene，thenpurifiedandclonedintopMD18一T vectorforsequencingre- spectively．TheresultsindicatethattheprevalenceofPiCV infectionisserious，withpositive ratesof75 (108／144)．CapgenesofsixPiCV positivestrainsshare74．O 一100 ofnu— cleotidehomologywitheachother，andshare72．1 一10o％ofnucleotidehomologywithother 14PiCV strainsontheGenBank．PhylogeneticanalysisofPiCV showsthatsixPiCV positive samplesaredistributed into tWObranches，ofwhich fivestrainsform onebranchwith closer geneticrelationship，andonestrainHBLF formstheotherbranchwithmoredistinctgeneticre— lationship． Keywords：pigeoncircovirus；PCR；amplificationofCap gene；phylogeneticanalysis 鸽 圆环病毒 (Pigeoncircovirus，PiCV)属于圆环病毒科 圆环病毒属 ，呈球形，二十面体对称 ，无囊膜 ， 基 因组为环状单股DNA，大小为2．0kb左右 ，是 目前已知的最小的鸽病毒[1-2]。PiCV于 1993年首次报道 于美国，此后 ，加拿大、澳大