S7核糖体蛋白基因片段序列变异与花鲈属鱼类系统发育研究.pdfVIP

海洋湖沼通报 of and №2 2008年 Transactions OceanologyLimnology 文章编号：1003—6482(2008)02-0152-07 S7核糖体蛋白基因片段序列变异与 花鲈属鱼类系统发育研究 宋 林1，肖永双2。高天翔2。 (1．辽东学院，辽宁丹东118001；2．中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室。山东青岛266003) 摘要：对中国和日本海域花鲈属的3个种l花鲈(Lateolabrax maculatus)、鲈鱼(L．japoni— cud和高体鲈(L．1atus)的S7核糖体蛋白基因片段序列进行了扩增和序列测定．分析比较了 3个种23个个体间的序列差异。在456bp的S7核糖体蛋白基因片段中，3个高体鲈个体中 出现了3种单倍型，种内个体间有2个碱基差异；7个花鲈个体中出现了7种单倍型，种内个 体问有21个碱基差异；13个鲈鱼个体中出现了12种单倍型，种内个体间有22个碱基差异。 结果表明，花鲈属S7核糖体蛋白基因片段序列具有丰富的遗传信息，在亲缘关系较近的物种 问也存在显著的序列差异，基于S7核糖体蛋白基因片段序列的NJ和ME系统树经1000次 重复抽样检验后得到相似结果，表明S7基因内舍子2是适合于研究分子系统发育的分子标 记。利用Modehest选取最佳核苷酸替代模型构建的NJ树表明：花鲈属鱼类由高体鲈分化， 花鲈与鲈鱼的亲缘关系很近，而与高体鲈的亲缘关系较远。 关键词：花鲈；鲈鱼；高体鲈lS7核糖体蛋白基因 中图分类号：Q959．483 文献标识码：A 花鲈(Lateolabrax 年新描述的种[¨，主要分布于中国沿海，南到中越交界的北部湾，北到朝鲜近海[2]。花鲈是东 北亚特有种、分类学代表种、解剖学模式种，也是海水增养殖的主要经济鱼种之一。花鲈是名 贵的经济鱼类，由于其肉味鲜美而广受欢迎[3]。近年来，过度捕捞和环境变化使花鲈的资源量 急剧下降。同花鲈相比，鲈鱼的分布范围较小，主要分布于日本北海道以南的沿海海域到朝鲜 半岛的东南沿海海域[2—3；高体鲈仅分布于日本静冈、长崎等南部近海海域[3]。 S7核糖体蛋白基因(S7基因)是不连续的蛋白编码基因，由一系列的内含子和外显子串 联而成，其内含子中包含核仁小分子RNA的编码序列。研究表明，除内含子长度外，S7基因 组结构在关系较远的脊椎动物类群中均表现较高相似性；鱼类S7基因包括7个外显子和六个 内含子，其中内含子1和2的序列长度比较适中而且容易扩增，比两栖类和人类结构紧凑而被 作为宿主基因内含子编码功能研究的有效模型[5’6]。迄今，国内有关淡水鱼类S7基因的研究 报道极少，尚未用于海洋鱼类系统发育的研究。本研究将S7基因内含子2用作系统发育研究 的遗传标记，探讨其用于花鲈属鱼类系统演化研究的可行性，以为花鲈属鱼类的系统发育研究 寻找新的遗传标记，同时也为其他海洋鱼类的系统发育研究提供参考。 计划(2005CB422306)资助 第一作者简介，宋林(1965一)，女，实验师，主要从事生物化学研究 -通讯作者：高天翔，E-maillgaozhang@OUC．edu．Cll 收稿日期-2007—08—04 万方数据 2期 S7核糖体蛋白基因片段序列变异与花鲈属鱼类系统发育研究 153 1材料与方法 1．1实验材料 花鲈属3个种的23个样本采集于中国和日本海域如表1所示。取鳍条或肌肉样品95％ 乙醇固定后，一20℃保存备用。 表1样品取样信息。包括样品种名．缩写、取样地点时间、样本量、单倍型数和碱基差异数 Table1 Listof names．sampleabbreviation-collectinglocation-collectingtime-