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SARS病毒E蛋白的计算机模拟的初步研究.pdf
Vol. 24 高 等 学 校 化 学 学 报 No. 8
年 月
2 O O 3 8 CHEMICAL JOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES 14O6~ 14O9
病毒 蛋白的计算机模拟的初步研究
SARS E
陈彦涛 罗钟琳 丁建东
复旦大学高分子科学系 聚合物分子工程教育部重点实验室 上海
( 2OO433D
摘要 以粗粒化的多肽链模型进行了 病毒包膜中 蛋白的计算机模拟 描述了该蛋白质空间构象的
SARS E
概貌 首先扩展了多肽链的 模型 使之能够用于研究在水或脂环境下蛋白质折叠的行为 并且考虑了全
. HP
部氨基酸残基疏水相互作用能的差异 相关格子链的 模拟显示了很高的计算效率 模拟再现了
. Monte Carlo .
蛋白质的 转变 验证了蛋白质序列分布的重要性 结果表明 在水环境中 蛋白质空间结构由
.
- E
coil globule
紧致的疏水内核和部分向外延伸的亲水片段组成 在脂环境中 中部疏水片段会成为向外延伸的环 而当两
;
侧紧致的亲水片段分开时 则形成桥.
关键词 蛋白质折叠 计算机模拟 高分子构象统计 冠状病毒 生物信息学
; ; ; SARS ;
中图分类号 G939. 4 文献标识码 A 文章编号 O251-O79O (2OO3D O8-14O6-O4
自 年底非典型性肺炎 简称 突发以来 相关研
2OO2 (Severe Acute ReSpiratory Syndrome SARSD
究在世界范围全面展开[1~ 4 随着几个 菌株基因组序列的公布 人们可以根据已有的生物信息
. SARS
学(BioinformaticSD 知识很快地预测该病毒中蛋白质的个数和氨基酸序列. SARS 病毒是一个有包膜的
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