第二章生物反应动力学.pptVIP

* * 第二章 生物反应动力学（8学时） 基本要求： 掌握简单酶催化反应动力学、有抑制的和复杂的酶催化反应动力学，掌握影响酶催化反应速率的因素，以及动力学参数的求取。 了解微生物反应过程的计量学，掌握分批培养时细胞生长动力学、底物消耗及产物生成动力学，学会细胞反应动力学参数的估算。 了解细胞内生物反应－代谢工程的基础知识，掌握简单的代谢流量分析，介绍代谢工程进展。 重点： 各种情况下的酶和细胞反应（过程）的动力学方程及其在形式上差异、简单的代谢流量分析。 难点： 酶催化反应动力学机理方程的推导。 第一节 均相酶催化反应动力学 酶催化反应过程分为：均相酶催化反应过程和非均相酶催化反应过程。 均相酶催化反应 定义: 指酶和反应物系处于同一相(液相)中的酶催化反应. 特点: 不存在相间的物质传递.所描述的反应速率与反应物系的基本关系反映 了该反应过程的本征动力学关系,是分子水平上的反应.本征动力学可以 说明反应机理,即阐明各基元反应如何进行,也就是反应历程. 研究均相酶催化反应的目的:阐明反应机理及设计反应器及其操作. 非均相酶催化反应 指酶和反应物系不处于同一相(液相)中的酶催化反应，同时还存在固相或另一个液相，因而存在相间的物质传递。这些情况主要有固定化酶反应、双水相酶反应及有机相酶催化反应等。 这部分内容将在第三章生物反应器中的传质与传热中讨论。 1 简单的酶催化反应动力学 指由一种反应物(底物)参与的不可逆反应，例如酶催化的水解反应和异构化反应。可以写为： 其反应机理可以认为是：首先是底物S和酶E相结合形成中间复合物[ES]，然后该复合物分解成产物P，并释放出酶E。即有： 上述反应的速率可表示为: 底物的消耗速率,mol/(L.S) 产物的生成速率,mol/(L.S) 上式中：V--反应体系的体积,L. --为底物S和产物P的量,mol. t—为时间,S. 根据质量作用定律,P的生成速率可以表示为: 由于中间复合物[ES]的浓度 为一难测定的未知量,因此不能用它来表示最 终的速率方程.为此,需用反应体系中的可测量来代替该未知量.这样得到的反应速 率方程可以用来描述反应的进行,知道随着反应的进行各组分浓度的变化情况,据 此可以设计相关的反应器. 下面我们来推导.对于上述反应,我们假设: 在反应过程中,酶浓度保持恒定,即 与底物S的浓度相比,酶的浓度很小,因此可以不计由于生成中间复合物[ES]所消耗的底物. 产物的抑制作用不计. 有两种推导反应速率方程的方法:平衡假设法和拟稳态假设法. 平衡假设法—Michaelis-Menten方程 平衡假设：认为酶催化反应历程中，生成产物一步的反应速率要慢于底物S和酶形成中间复合物的可逆反应速率，因此生成产物一步的反应速率决定整个酶催化反应的速率，生成复合物的可逆反应则达到平衡状态。 根据假设有： 根据生成复合物的可逆反应有： 最后一式即为M-M方程。 该方程中引入了两个参数： --P的最大生成速率,mol/(L.S). M-M方程是一个两参数方程。 当从中间复合物生成产物P的速率与其分解成酶和底物的速率相当时，M-M方程不适用。 拟稳态假设法—Briggs-Haldane方程 拟稳态假设：认为由于反应体系中底物浓度要比酶的浓度高得多，中间复合物分解时所得到的酶又立即与底物相结合，使得反应体系中复合物的浓度维持不变，即中间复合物的浓度不随时间变化，即： 根据反应机理和拟稳态假设，有下述方程式： 最后一式即为B-H方程。 该方程中引入了两个参数： M-M方程和B-H方程的比较见书P19表2-3。 几种特殊情况的讨论： 定义：催化活性中心速率常数 对于M-M和B-H方程， 存在多个中间复合物 存在多个产物中间复合物 例题：P24 例2.1,例2.2。 思考题：试推导上面两个 。 动力学特征和参数求取 M-M方程所表示的动力学关系为反应速率与底物浓度之间的关系，即 关系。其图如右所示。 该曲线表示了三个不同动力学特点的区域： 当 时，即底物浓度比值小得多时，该曲线近似为一直线。这表示反应速率与底物浓度近似成正比关系，此时的酶反应可以看为一级反应。此时，大部分酶为游离酶，与底物结合的酶很少，要提高反应速率，只有增加底物的浓度，才能增加中间复合物的浓度，反应速率主要取决于底物浓