第三节：下一代测序技术与其他技术平台-20150319.pdfVIP

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2015-09-11 发布于四川
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第三节：下一代测序技术与其他技术平台-20150319.pdf

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第三节：下一代测序技术与其他技术平台-20150319

第三节：下一代测序技术与其他技术平台孟山都现代基因组选择辅助的精确耕种 (Genomic selection-assisted precision planting) 种子（条形码编码）切割机器人种植带有优良基因型基因型选种道格拉斯Array Tape利用SNP分子从种子上取一小块组织标记对几万颗种子鉴定基因型基因组选择辅助的精确育种策略农艺性状优良品种候选育种材料的收集 (训练群体~100) (候选群体 ~10,000) 基因组选择预测模型的构建 1. 线性回归模型基因组测序(基因型) 基因组测序(基因型) 候选材料的育种价鉴定控制优良性状的基因值 (GEBV)评估选择育种价值较高的材料 (基因组关联分析) (实验群体 ~100) 对产量、抗性等性状进行预测图周期从7到8年缩短到3到5年锁连 0 设计大田育种实验方案状大数据技术支持性因- 的组学数据挖掘基谱和育种平台一、二、三代测序技术原理介绍测序技术发展里程第一代测序：Sanger法测序， 1970年，30亿美元测人类基因组（一条1 Kbp DNA序列）第二代测序：(或新一代Next Generation，或高通量测序High-throughput sequencing，或并行测序Parallel sequencing, 或深度测序Deep sequencing，或边合成边测序 Sequencing by Synthesis, 等很多名称) 1. 454焦磷酸测序2004 （几万条读长＝200~500nt ） 2. Solexa测序2006 （几百万读长＝36nt ） 3. ABI SOLiD测序2006 （几百万读长=50nt ） 4. Illumina GA II 2007 (几千万条读长=70nt) 5. HeliScope单分子测序2009 6. ION torrent 测序2010-2014 （准三代，几十万条读长=500nt ） 7. Illumina HiSeq2000测序平台2010-2013年 (几千万条100-nt短序列)