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PowerPoint 演示文稿 - 河南师范大学
项目 遗传图谱 物理图谱 标 记 基因 多态性序列 STS 单 位 cM bp kb Mb 信 息 生物信息 物理信息 标 志 路标 界标 距 离 相对距离 绝对距离 位 置 连锁关系 相对位置 位置关系 绝对位置 分辨率 低 ,600kb 高,100kb 精确性 低 高 操 作 难度大 容易 3、序列图谱(人类基因组计划的核心) 1)概念:人类基因组30亿对核苷酸的排列顺序的图 2)测序流程: 选择物种 分离DNA 获得大量DNA 切割成重叠片段 片段插入载体 组装 测序 大量克隆 3)测序方法 20年前,一台仪器每天只能测500bp,人类基 因组测完需要18000年,因此,有人激烈反对 此计划, 1985年发明的第一台测序仪仪每天测15000bp, 以后有加速到400000 bp. 1998年发明ABI3700DNA分析仪、MegaBACE1000DNA 测序仪每分钟既可测12000bp,不到15个月就测 完了人类基因组的90%. 北京中心每天可测3千万bp,是世界上第六大测序 中心.费用也从开始的每碱基10美元降到了10美分 链终止法(1977,Sanger) 原理1:聚丙烯酰胺凝胶电泳可以把长度只差一个核苷 酸的单链DNA分子区分开 原理2:复制时ddNTP一旦结合上去,就使其它核苷酸 不能再往上结合,(ddNTP缺少可连接下一个核苷 酸的3’羟基)形成长短不一的单链DNA分子 每个反应器中有 3’ 5’ 单链DNA 5’ 3’ 引物DNA Klenow酶仅具3’ 5 ’外切活性 dNTP 其中dATP是32P标记的 ddATP 是双脱氧的 dNTP dNTP dNTP dNTP ddATP ddTTP ddCTP ddGTP 反应器1 反应器2 反应器3 反应器4 ddATP ddATP ddATP ddATP 各反应器中的dNTP都用32P标记,利于电泳后观察 1 2 3 4 A T C G 1 2 3 4 A T C G 5’ TGATACGACGAAGTACTGG 3’ 3’ ACTATGCTGCT TCATGAC
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