一种基于分数阶微分方程模型的基因调控网络构建方法.pdf

ofXi’an of No．2 127 西安理工大学学报Journal UniversityTechnology(2011)V01．27 文章编号：1006-4710(2011)02-0127-06 一种基于分数阶微分方程模型 的基因调控网络构建方法 季瑞瑞，刘丁 (西安理工大学自动化与信息工程学院，陕职西安710048) 摘要：考虑到实际生物系统的非线性特性。提出了一种基于分数阶微分方程模型构建基因调控网 络的新方法，采用模型预测数据与实际数据的逼近误差为目标函数，通过人工鱼群优化算法辨识分 数阶微分方程模型的阶次和参数，并引入自适应步长，保留精英个体和增加种群多样性等策略提高 算法的进化能力。对真实生物实验数据的结果表明，该方法能够较准确的辨识出模型参数，得到的 分数阶微分方程模型与实际数据吻合程度较高。 关键词：基因调控网络；分数阶微分方程；人工鱼群算法；参数辨识 中图分类号：TP301．6 文献标志码：A AReconstructionMethodofGene NetworkBasedon Regulatory FractionalOrderDifferential Equation JIRuimi，LIU Ding andInformation ofAutomation Engineering，Xi’anUniversityofTechnology，Xi’an710048，China) (Faculty thenonlinearcharacteristicofreal novelreconstructionmethodbased Abstract：Considering biosystem，a onfractionalorderdifferentialis errorof datatorealda— equationpresented．7111eapproximationpredicted taisconsideredasthe function．artificialfishswarlTI isservedasatoolto the objective algoritllm identify and inthemodel．The ofthe isenhanceda- evolvability powerparameters optimizationalgorithm through excellentindividuals the and ofswarms．rnle daptivestep．preserving increasingdiversity experimental datashow this methodinfer resultsonreallife that can model gene