杯芳烃衍生物对脂肪二酸及其卤离子识别的理论的研究.pdfVIP

摘要 本文以二酰胺吡磋修饰杯【4】芳烃，脂肪二羧酸及二者形成的主一客体复合 物和杯[n】二吡咯及杯【n】二毗咯一卤素阴离子复合物为研究对象，应用分子力学、 分子动力学和量子化学方法进行了计算研究，研究工作主要包括以下三个方面： 1．采用分子力学，分子动力学模拟，对二酰胺吡啶修饰杯[4]芳烃与系列脂肪 二羧酸的分子识别进行了研究。结果表明，不同链长的脂肪二酸与主体分子的酰 胺基团以多氢键相结合，结合能力随链长的增长而增加。进一步研究表明，动力 学模拟计算的平均结合能和根据动力学以及溶液动力学模拟得到的稳定构象所 计算出的结合能均与实验值吻合得更好。 2．应用分子力学／分子动力学模拟，对杯[n]二吡咯和杯[n】二吡咯一卤素阴离 子复合物进行研究，为了比较，对杯[4】吡咯和杯[4】吡咯一卤素阴离子复合物也 做了同样的研究。结果表明，卤素阴离子与所有吡咯NH基团上的H原子形成 氢键，同一主体分子，对卤素阴离子的结合能力由F一到I一逐渐减弱；与杯[4]吡 咯相比，杯[11】二吡咯对同一卤素阴离子的结合能力增强，真空动力学模拟和溶 液动力学模拟表明模拟过程中主体分子，复合物构象基本不变，保持稳定构象。 3．运用密度泛函B3I_，YP方法，对杯f41二吡咯主体分子及其卤素阴离子复合 物进行了研究。结果表明，杯[4】二吡咯可与卤素阴离子形成具有较高对称性的 复合物，其8个吡咯NH基团上的H原子均可以和卤素阴离子形成氢键：杯[4】 二吡咯与卤素阴离子结合的顺序为FCl一Br一r。振动光谱、电荷分布以及前 线轨道计算结果表明，杯【4】二吡咯与卤素阴离子相互作用的本质为氢键，经 BssE校正的结合能与电荷转移程度、N—H键键长、N—H伸缩振动频率的变化 呈线性关系。 关键词：分子力学分子动力学密度泛函理论主一客体相互作用氢键 AbStraCt h a andcompkes¨th In“s caliX【41arene paper，bis(amidopyridine)一linked seriesof and aliphaticdicarboxylicacids；calix【n]bipylToles and a11ion are molecularmechallics，moIeclllardynamics investigated complexes by includcs： studymai川y dens耐nmct哑meo咣9FD．our 。 wasusedto a11dⅡ10lecularsimulations nMoIecul_；lrmecha儆cs dynarnics m01ecular of anda calix【4】arene investigate rccognmonbis(amidopyridine)一1idked resultsindicatemat seriesof multiple