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蛋白质蛋白质相互作用数据库的研究进展
·综述·
蛋白质.蛋白质相互作用数据库的研究进展
李静傅松滨
【摘要】 随着人类蛋白质组学的飞速发展,出现了大量的蛋白质相互作用及其网络数据,因此寻
找和预测蛋白质相互作用的生物信息学方法成了研究蛋白质互作必不可少的_T具之一,本文主要从生
物信息学角度对蛋白质相互作用数据库做一下简单的介绍,包括各数据库的来源、主要功能、应用范围、
目前的发展状况及将来的发展方向等方面。
【关键词】 蛋白质相互作用;蛋白质相瓦作用网络;蛋白质相互作用数据库;生物信息学预测
TheResearch inProtein-ProteinInteractionsDatabaseU
Progress Jing‘.FUso唱一bin.(‘Laboratory
Medical Medical 15008
of Genetics,Harbin I,China)
University,Harbin
author:FU
CorrespondingSong—bin.E—mail:舢6@em$.hrbmu.edu.cn
and
the of more interactionand
【Abstract】Withdevelopmentproteomics,moreprotein—protein
rapid
networkdatahavebeen and interactionbioinformaticsbecome
reported.Identifyingpredictingprotein—proteinby
will
oneof toolsfor research.Wereviewanddiscuss interactiondatabasesre-
necessary protein protein-protein
latedto its andfuture
bioinformatics,includingresources,majorfunctions,application,currentdevelopment
trend.
interaction of
I network;Databases
Keywords】Protein·proteininteractions;Protein—protein protein-
Bioinformatics
interactions;
protein predict
蛋白质是生命功能的执行者,也是生命现象的
直接体现者,对蛋白质结构和功能的研究将直接阐 质相互作用的网络图谱,从基因功能注解、网络对
明生命在生理或病理情况下的变化机制,而蛋白质 比、文献挖掘角度进一步分析各个蛋白质的定位、功
功能的实现离不开蛋白质与蛋白质或蛋白质与其他 能和相瓦作用的关系。一些基于数据库预测蛋白质
生物大分子之间的相互作用。蛋白质的相互作用以 相互作用的方法将为实验技术提供有利的依据,同
细胞结构,生化活性和能动行为为基础,反过来,遗 时实验技术义可以为数据库提供充分的数据资源和
传的相互作用影响着广大蛋白网络功能的联合…。 结果验证,两者对于研究蛋白质相互作用起了至关
研究蛋白质相互作用的网络是
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