小麦TaCCaMK基因EF手性结构域的SNP及其与抗旱、耐涝性的关系.pdfVIP

小麦乃CCaMK基因EF手性结构域的SNP 及其与抗旱、耐涝性的相关性 摘要 环境胁迫如干旱、土壤盐渍化和涝害等严重影响了作物的生长和发育，从而降 低作物的产量。小麦是我国第二大粮食作物，随着人口的增长和可利用耕地面积的同 益减少，通过小麦基因单核苷酸多态性(SNP)，探寻小麦基因与环境胁迫的相关性， 发掘优异的抵御环境胁迫的小麦基因资源，对于培育高产小麦品种，促进农业的发展 具有重要的理论意义和实际应用价值。TaCCaMK基因是从小麦基因组中克隆获得的， 编码依赖于钙／钙调素的蛋白激酶。目前研究表明，TaCCaMK基因在小麦干旱、盐胁 迫过程中均有响应。 本研究以普通小麦的二倍体野生近缘种3份、四倍体野生近缘种1份、中国春小 麦、一套以中国春为背景的缺体四体以及耐涝性小麦3份和抗旱性小麦5份为研究材 料，从基因结构、染色体定位、TaCCaMK基因EF手性结构域的结构分析以及通过 基因进行了研究，获得如下实验结果： 1)TaCCa臌因包含7个外显子，6个内含子。在不同二倍体野生近缘种材料中， 内含子数目及插入位置变化不大。内含子大小略有差别，说明该基因在进化过程中的 保守性。 分别在1A、1B、1D染色体上至少各存在2个拷贝，两个目的片段在大小上仅相差三个 碱基。 3)在小麦的演化过程中，各个基因组上EF手性结构域序列都发生了各自特有的 变异。其中以B基因组上的变异最大，A、D基因组上的较为保守。不同基因组上该结 构域存在不同程度的碱基变异，这可能与它们分别承受的选择压力不同有关。 域的亲缘关系为：A与B基因组的亲缘天系较近，而与D基因组亲缘关系较远。另外， 对B基因组中的EF手性结构域而言，四倍体与六倍体B基因组的亲缘关系较近，而与 二倍体B基因组的亲缘关系较远。 5)在两种抗性材料之间，EF手性结构域的SNP非常丰富。在3份耐涝性材料和一 11nDel／1 更为丰富。同时在两种抗性材料中检测到，B基因组中的SNP较A、D基因组中SNP丰 富很多。 “ 6)单倍型分析揭示了来自不同基因组的砀a∞雌因与抗旱、耐涝性的相关性。 在A基因组中的勋CI力臌因与抗旱性有一定的关系，而与耐涝性关系不明显：B基 因组中的该基因与抗旱、耐涝性都有一定的对应关系；相反D基因组中的该基因却与 抗旱：耐涝性都没有相关性。说明不同基因组中的砀CC口MK基因的同源基因在抵御 干旱和涝害的过程中具有不同的作用，即不同基因组中的同源基因对不同的胁迫有不 同响应。 关键词：小麦；TaCCc燃因；单核苷酸多态性；抗旱性；耐涝性 BETWEENSNPOF勋C’Ch朋K CORRELATION GENEEFHANDSDoMAINANDDRoUGHT INWHEAT ANDFLoODToLERANCE Abstract Environmentalas andfloodhaveall stresses，suchdrought，salinity significantimpact on isthesecond inChina．With cropproductivity．Wheatimportantcrop increasing and arable theSNPof tosearchforthe populationdecreasingland，Using genes bettwenenvironmentalstressesand andtodiscovernovel associativity