三链 DNA 的结构研究进展.pdfVIP

维普资讯 ?5(i，) 些堂逭攫 塑 芏墨 塑 三链 DNA 的结构研究进展 (中国科学院化学研究所，北京 100080) ／-’ 摘要 本文重点介绍丁三链 DNA的结构基础、 实验研究以爰丹子结构筷型理论研究的新进展。 … 三链～… … … 三 收吱 键呻 始于 1957年的三链核酸的制备、结构和生 一 物学功能的研究，到今天已经发展成为生物化 、 三链 DNA的结构 学、分子生物学和基因工程领域的一个新兴的 基元一三碱基体 的研究 前沿课题，越来越多的证据表明：三链DNA可 能存在于活体内，并参与细胞 内那些涉及到 众所周知，双螺旋DNA是 由两条互相缠绕 DNA的过程；通过三链DNA的形成，寡核苷酸 且方 向相反的单链多聚核酸组成的。单链核酸 能对大分子DNA的许多特异性序列，进行 比限 是由四种核苷酸：腺嘌呤 (A)、鸟嘌呤 (G)、胸 制性 内切酶高得多的专一性识别，并可在作为 腺嘧啶 (T)和胞嘧啶 (c)核苷酸组成的。核 序列专一性的切割DNA的 分子剪刀”、基因 酸骨架 由呋哺糖两边各接一磷酸根而成，由于 调控以及阻止DNA与蛋 白质结合的一种有效 一 种核苷酸的磷酸根一边与另外一核苷酸的呋 方法等方面具有潜在的应用前景[1]。 哺糖环上的3r碳原子上的羟基相连 ，同时磷酸 经过近三十多年的研究，人们发现同型嘌 根的另一边则与 5碳原子上的羟基相连形成 呤和同型嘧啶、单链寡脱氧核糖核酸 (以下简 磷酸二脂键，因此核酸链具有方 向性。另外 称 ODN)和天然双链 DNA之 间可 以形成分子 Waston—Crick(以下简称w—c)双螺旋的两条链 间三链DNA；在负超螺旋应力的诱导下 ，含 同 严格互补 A【对 T，C对 G)，碱基对处于两条 型嘧啶一同型嘌呤链的双螺旋DNA，经过一个 链之间；同时由氢键配对的核酸碱基并不在核 依赖于 pH的结构转变 ，可 以形成分子 内三链 酸螺旋的轴上 ，因此形成的双螺旋是不对称的； DNA H【—DNA)；以及某些线性单链DNA分子 一 面是大淘，一面是小沟 。 形成分子内三链 DNA；我们采用STM还发现 实际上，正是 由于双螺旋中大沟的存在，才 在变性~．-DNA中存在三辫DNA[ “。目前 ，通 为第三股DNA缠绕到双螺旋上形成三链 DNA 过x一射线纤维衍射一 、NMRCv-9]等多种手段 ， 提供了结构基础 。 获得了一些三链核酸结构的有用信息，但是关 与双螺旋相类似 ，三螺旋DNA的组成结构 于这些三链 DNA的x一射线单晶衍射数据 尚未 基元是三碱基体。目前一般认为三碱基体有嘧 见报道。在这种情况下用分子力学手段构筑三 啶一嘌呤一嘧啶 (PypuPy)型 (如TAT、CGC一)、 螺旋的分子模型 ，无疑将有助于人们获得三链 嘌 呤一嘌 呤一嘧 啶 (PuPuPy)型 (如 AAT、 pNA的更详细结构信息。本文扼要地介绍有关 GGC)两种基本类型 。这些三碱基体也具有专一 三螺旋DNA结构研究的新进展 性，具体体现在T、C 、G、A分别要接在AT、