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化学结构的计算机处理III立体化学的贮存与检索
第 15 卷 第 4 期 计算机与应用化学 V o l. 15 N o. 4
1998 年 7 月 28 日 Computers and A pp lied Chem istry July 1998
·综述·
化学结构的计算机处理 ( III)
立体化学的贮存与检索①
姚建华
( 中国科学院上海有机化学研究所, 中国科学院计算机化学开放实验室 上海 200032)
摘 要 目前应用最广泛的基于连接表的化学结构表述方法本质上只适于表述分子的拓扑, 即只
能考虑分子结构中原子间的连接关系, 而不能描述它们在空间中的排布。然而, 两个具有相同原子
拓扑的分子, 在三维空间中的真实结构可能是不相同的, 其性质也不尽相同, 这种现象被称为分子
结构的立体化学。实用的计算机化学结构描述方法必须能处理立体化学。本文简要地综述了基于连
接表的手性中心和双键立体化学的描述方法。
关键词 C IP 约定, 手性标记, 组成化学, 立体化学
中图号 T P 319: O 641. 6, O 641. 6
COM PUTER HANDL ING OF CHEM ICAL
STRUCTURES ( III)
The Storage of Stereochem istry
of Chem ica l Structures in Com puter
YAO J ian - hua
( , ,
L aboratory of Comp u ter Chem istry S hang hai Institu te of O rg anic Chem istry
Ch inese A cad emy of S ciences, S hang hai, 200032)
ABSTRACT T he mo st w idely used rep resentation of chem ical structures w h ich isbased on connec
, . .
tion table is essentially only suitable to describe thetopo logy of mo lecules i e it only can rep resent
the bondings betw een the atom s in a mo lecule, rather than their spatial arrangem ents ( topography).
How ever, two mo lecules w h ich have exactly the sam e topo logy c
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