DNA修复相关基因的耐辐射球菌基因组进化生物信息学.pdf

摘要 研究不同的物种已经鉴定出了许多DNA修复的途径。在比较研究中，进化 的观点是颇为有用的，其不仅仅是简单的鉴定途径的不同之处，而且还着重了 解不同是怎样产生的。在本文中，我们展示了DNA修复蛋白及过程的比较分析。 基于现有数据库序列，我们较为详尽的研究了RecX家族及MutT／Nudix超家族 这些与DNA修复相关的基因，将有利于了解DNA修复途径的起源进化，也将 增进我们对于DNA修复的理解。在DNA修复的研究中，不仅对于理解物种间 修复的差异，而且对于修复的过程，我们相信进化的观点都是举足轻重的。耐 辐射球菌(Deinococcusradiodurans)是目前所知最抗辐射的生物之一，研究耐辐 射球菌的DNA损伤和修复途径展示了其极度的对于电离辐射、紫外线和活性氧 的抗性。而完整的基因组序列为研究不同物种中的DNA修复提供了潜在的新材 料。比较耐辐射球菌和新近完成的Deinococols geothermalis基因组的数据将对 于奇球属中细菌的多染色体的起源和进化的深入了解大有裨益，或许对于耐辐 射球菌的抗性解释有新的启示。 活性。在耐辐射球菌当中，RecX不仅下调recd基因的转录，而且也直接在蛋白 质水平上抑制ReeA的活性。Dinl和RccX蛋白组