蛋白质主链双氨酸的三转角之计算与分析.pdfVIP

摘 要 蛋白质的功能与其结构关系密切，了解蛋白质的结构有助于了解它们的功 能。但获得蛋白质结构的传统方法一进行x射线晶体衍射和核磁共振实验一需 要巨大的时间和金钱上的开销，在生物数据激增的今天，预测蛋白质的空间结 构变得十分重要。分析已知的蛋白质的空间结构有助于预测未知的蛋白质的空 间结构，因而，蛋白质空间结构的分析成了生物信息学的一个重要课题。 本文以沈世镒教授提出的蛋白质主链结构的三角形拼接带模型为基础，根 据蛋白质三维结构数据库(PDB)提供的原子坐标和空间解析几何知识，计算 了蛋白质主链上双氨酸的三个转角，并对它们进行了一些分析。主要结果有： 双氨酸三个转角的计算方法，由此得到的三转角数据库，第二个转角的分布拟 合结果以及第一个和第三个转角的联合分布分析。利用这些结果有助于我们对 蛋白质空间结构的理解与预测。 关键词： 蛋白质主链结构的三角形拼接带，双氨酸的三转角，分布拟 合，联合分布分析 Abstract havea Proteins’functionsclose wittl廿leirs呲tures．Theof mastery rclanonship pr0一 teins’strIlcturesis tounderstandtlleir 0f helpful fIlnc吐彻s．However’山e仃admonalmethods aS tlle acquiringproteins’sⅡ．1lctures，suchexperimentScrystalloiddiffrac． conducting ofX-my Ⅱonand time柚dneedenonnoIls NMR(NuclearMagneticResonance)，takelong expenses． dataare itbecomes to Nawadays，biologicalexpandingra棚棚y柚d very importampredict山e structures thel(IIown stmctures to spatial ofproteins．Sinceanalyzing spadal ofproteinshelps of tI】eunknown，me stnlcmrcsof becomesan predict analysjsspatial pmteins imponanttopic ofbioinforIIlatics． In onttle beltmodel this出esis，based whichhasbeen trian91e ofproteins’backbonespm． au由or Shen，tlle threcmtated oftwOaminoacid pose