蛋白质晶体中的直接法研究.pdfVIP

摘要 摘要 OASIS程序将直接法与常用的蛋白质晶体学方法相结合，用于推演蛋白质晶体的衍射 相位，已经证明非常有效。本文吏进一步从理论、应用和自动化三个方面，发展了0ASIS 的方法和程序。 位的双峰概率分布表示为中心值存‰”+I△纸I和仇”一I△饩l的两个高斯概率分布之和。利用 乘以中心在‰”+l△纨I的高斯分布以及P一(=l—P十)乘以中心在纯”一|△仇J的高斯分布来破解。 这种破解相位模糊的方法已经证明是行之有效的，特别是存反常散射信号微弱的情况下。 但是将相位概率分布表达为两个高斯分布的和会带来一些不可忽略的误差。本文利用vorl Mises分布代替高斯分布来拟合SAD相位的双峰概率分布，使拟合的精度大为提高，从而显 著地增强了OASIS推演SAD相位的能力。 程序中含有两种利用双空间迭代以扩展部分结构的功能。第一种是利用单波长反常衍射 3．我们开发了一个用于设定和实时监控自动化迭代过程的用户图形界面(GUI)本文将 详细介绍这个图形界面的功能。 关键字：直接法、大分子晶体学／蛋白质晶体学、双空间部分结构扩展、OASIS Abstr