分子内非简性和小极化子结合能对α螺旋蛋白质链双振子动力学的影响.pdfVIP

摘 要 螺旋蛋白质分子的双振子动力学性质。在不含时体系中重复了部分前人的 理论推导工作，包括经过两次么正变换“消除”分子内非简谐项和振子． 声子耦合项，使Amide．I振子哈密顿量的形式满足小极化子理论，此外， 经过严格的计算得到振子跳跃常数J3的正确表达式；在一定条件下求解薛 定谔方程得到双振子能谱，包括能量较高的连续带和两个能量较低的独立 能带，连续带对应双振子自由态(TVFs)，即两振子间距大于1个晶格位点， 能量较高)，即两个振子在同一位点和相邻位点激发。在波矢为0处， 讨两种非线性因素即分子内非简谐性和小极化子结合能连续变化时能谱 结构和两种双振子束缚态波函数的演变规律，并在相图上显示了两种非 线性因素的关系：当其中一个因素增强时，另一因素满足双振子束缚态形 成的临界值就会变小，除了出现TVB$．II的相变曲线外，还发现在两因素 都很弱的相空间存在出现TVBs．I的相变曲线。最后，从等效晶格中两个 级分裂的角度解释了这两种非线性因素对Amide．I振子动力学的影响。 关键词：Amide．I振子、a．螺旋、小极化子结合能、分子内非简谐性、 双振子自由态、双振子束缚态 Abstract Amodified model Pouthierwas todescribe Davydovpresentedby applied thetwo-vibron inan口-helix dynamics protein．Twounitary are toremovetheintramolecular and performed the anharmonicity strong to thethesmall vibron。phononcouplingsatisfy polaron whichthe form for constantwas right hopping J3 obtained．Withcertain twokinds ofboundstates belowthecontinuum parameters appear overthe wholebrillouinzone：the continuumnamedTVFs tothethe corresponds oftwovibronsontositesthat far trapping are thetwodifferent apart，while boundstatesnamedTVBs-IandTVBs·-IIrefer totwovibrons on locating nearest sitesandonthesame neighbor two-vibr