生高分生--病毒原核基因组.ppt

重复序列 反向重复（inverted repeat)（倒位重复）：由反方向互补的两个DNA片段组成，两个反转重复序列又叫回文序列(palindrome sequence)。 镜像重复(mirror repeat)：由反方向完全相同的两个序列组成。 直接重复(direct repeat)（串联重复）：由同一方向完全相同的两个序列组成。正向重复序列、顺向重复序列。 A.反向重复 5’ GGGACTTGCCTAGA TCTAGGCAAGTCCC 3’ 3’ CCCTGAACGGATCT AGATCCGTTCAGGG 5’ B.镜像重复 5’ GGGACTTGCCTAGAAGATCCGTTCAGGG 3’ 3’ CCCTGAACGGATCT TCTAGGCAAGTCCC 5’ C.串联重复 5’ GGGACTTGCCTAGAGGGACTTGCCTAGA 5’ 3’ CCCTGAACGGATCT CCCTGAACGGATCT 3’ 在线作业入口 在线答疑 二、乙型肝炎病毒（HBV） 复制起点 复制起始点 （82位点） 复制终止点 （32位点） 质粒的作用 原核生物中, 麻风分枝杆菌假 基因数最多, 大约为 753 个, 而鼠 衣原 体的假基因 数最 少, 只有 5 个。 * * 通过生物化学及其他相关知识的学习，我们已经知道，机体是一个高度有序的化学反应复合体，指导这些反应过程的遗传遗传信息就以核酸序列的方式贮存在细胞核中的DNA分子中，任何DNA结构和功能的改变都可能引起机体物质和能量代谢过程的异常，从而导致疾病的发生。这种基因突变与疾病的关系就现在来看，在某种程度上，比传统的体征（或症状）与疾病的对应关系更确切，或者说，更能反映疾病的本质。这使得人们有逐渐利用分子生物学的方法以DNA、RNA或蛋白质为诊断材料，通过分析特定基因的存在、变异、或表达情况对疾病进行诊断，这就是分子生物学检验技术。时至今日，他已不在是一个简单的技术，是各种检测技术彼此联系并构成一个相对独立的完整体系或系统，一门相对独立的学科。 在这门课程，全部十二章内容主要从四个大的方面展开讲述： 基因组的结构特征：原核生物、病毒、真核 基因与疾病的关系 生物材料的分离与纯化：DNA、RNA、蛋白质等 各种分子生物物学检验技术原理及其应用 今天我就先讨论原核生物基因组与病毒基因组的特征。 1982年将资料较齐全而能分类的病毒划分为7大群，分群的根据是基因组的核酸种类（DNA或RNA）、类型（ds或ss）和有无包膜。 7大群中包括59个科组： dsDNA，有包膜 4科 dsDNA，无包膜8科，1组 ssDNA，无包膜 3科，1组 dsRNA，有包膜1科 dsRNA，无包膜 1科，4个可能科 ssRNA，有包膜8科，1组 ssRNA，无包膜 4科，22组，1个可能组 如按宿主分类，则为： 细菌病毒10科 真菌病毒 3个可能科 植物病毒24组，1个可能组 无脊椎动物病毒 2科，1组 脊椎动物病毒9科 无脊椎、脊椎动物共有的病毒有6科，即痘病毒科虹彩病毒科、小DNA病毒科、披膜病毒科、布尼亚病毒科和小RNA病毒科，以及一个可能科，即二节段双链RNA病毒。 无脊椎、脊椎动物和植物共有的病毒有2科，即呼肠孤病毒科和弹状病毒科。 * * 1、双链DNA 多数动物病毒，如SV40（环状）腺病毒（线形）、疱疹病毒、痘病毒，环形、线形。 2、单链DNA 动物病毒中仅微小病毒为单链病毒； 3. 单正链RNA病毒：脊髓灰质炎病毒、SARS相关冠状病毒、鼻病毒。 4、单负链RNA病毒：流感病毒、副流感病毒、滤泡性口腔炎病毒 5、双链RNA病毒：呼床孤病毒、轮状病毒 6、逆转录病毒：人类免疫缺陷病毒、白血病病毒、肉瘤病毒 7、 噬菌体最常见的是单链DNA，还发现有双链环形 每个噬菌体或病毒DNA 也都含有一个复制子,能在一个感染循环中引发多次复制。 * * 传统的生物学观念认为真核生物的染色体是线状的，原核生物的染色体则是环状的。1992年我们却发现链霉菌（一类葛兰氏阳性的土壤细菌）的染色体DNA却是线状的。 ... 病毒：90%以上为编码区 真核： rRNA和tRNA为多拷贝 * 传统的生物学观念认为真核生物的染色体是线状的，原核生物的染色体则是环状的。1992年我们却发现链霉菌（一类葛兰氏阳性的土壤细菌）的染色体DNA却是线状的。 ... 病毒：90%以上为编码区 真核： rRNA和tRNA为多拷贝 * E. coli chromosome: 4.6 Mb = 4.6 x 106 bp x 3.4 ? = 1.6 x 107 ? = 1.6 x 10-3 m = 1.6 mm = 1,600¨μm Plasmids are about 100 times