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农村户用沼气池泥中微生物多样性分析.pdf
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摘 要
沼气发酵生态系统的复杂性与独特性决定了其中微生物的多样
性及基因资源的珍稀性,深入开展农村户用沼气池发酵微生物的研究
将加快农村沼气工艺的发展进程。本论文系统开展了农村户用沼气池
污泥微生物总DNA提取方法的研究;建立了农村户用沼气池污泥微
生物16S
气池污泥样品中mcrA功能基因多样性研究。获得了如下主要研究结
果与结论:
DNA
首先,采用化学裂解法、溶菌酶裂解法和QIAampStoolMini
Kit提取了沼气池污泥样品中微生物的总DNA,对三种方法的DNA
得率、纯度、大片段提取效果以及是否含有PCR反应抑制剂进行了
研究,最后对16S
rRNA基因V3区的扩增产物进行了PCR变性梯度
DNA
Stool
凝胶电泳(PCR.DGGE)分析。与化学裂解法和QIAamp
Mini
Kit法相比,溶菌酶裂解法得到的DNA量大,片段长,片段分
可更好地展示沼气池污泥中微生物的多样性。
其次,通过对PCR.DGGE条件的优化,建立了农村户用沼气池
污泥微生物16S
PCR.DGGE技术分析了沼气池污泥中细菌和古菌微生物多样性随沼
气池深度的变化规律,结果表明农村户用沼气池污泥中含有丰富的微
生物资源,其中细菌群落受污泥深度因素影响小,而浅层污泥中古菌
群落与深层污泥中古菌群落却存在明显差别。
最后,通过构建污泥样品mcrA功能基因克隆文库,应用RFLP技
术,开展了农村户用沼气池污泥样品中与次级代谢产物相关的功能基
因多样性研究。结果表明,所采集的沼气池污泥中含有较为丰富的产
甲烷菌资源,但其中也可能存在类似功能或产生类似代谢物质的产甲
烷菌。
本论文的意义与主要创新点是:建立了农村户用沼气池污泥微生
物多样性分析平台,并初步分析了农村户用沼气池微生物多样性,不
仅为进~步优化沼气发酵微生物群落结构、筛选功能基因提供了科学
依据,而且为实现高效、可控的农村沼气发酵工艺奠定了基础。
关键词:农村户用沼气池,总DNA提取,变性梯度凝胶电泳,限制
性片断长度多态性,微生物多样性
Ⅱ
ABSTRACT
Microbe in and fermentation
inhabitingcomplicated
specialbiogas
theenormous and
ecologicalsystempossess immense
geneticdiversity
to new attentiontothe
potentialproduce
secondary
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