大青杨顶芽cDA文库构建及ESTs分析.pdf

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大青杨顶芽cDA文库构建及ESTs分析.pdf

摘要 摘要 Construction eDNA Kit成功构建了大青杨顶芽cDNA文库,从文库中随机挑选单 Library 克隆测序,用表达序列标签(EST)法研究大青杨顶芽的基因表达。 平板检测结果表明构建的文库滴度为7.2x 序列分析结果表明插入片段平均长度大于500 bp。这表明我们成功构建了大青杨项芽 cDNA文库。 的功能注释,占总独立基因的25.41%;822条独立基因为未知基因,占总独立基因的 42.28%;624条独立基因为未命名蛋白,占总独立基因的32.10% 大青杨顶芽eDNA文库经Nr比对后可知文库中也包含有细胞内磷酸激酶、核糖体 蛋白等与植物生长发育相关的基因。这些酶和蛋白与植物的生长发育密切相关,为进一 步研究杨树生长发育的分子机理奠定了理论基础,也为开发利用杨树基因资源提供了分 子生物学基础。 关键词大青杨顶芽;cDNA文库:表达序列标签 Abst,’act Abstract budsof Kom.wasusedas totalRNA Top Populus.ussuriensis experimentalmaterial,and wasextractedfromthe buds,weusedCreator.SMART.cDNAConstructionKitto top Library theeDNA construction themethodsof Library.We independentclones,used Sequenced ExpressedSequenceTags(ESTs)forgeneexpression analysis. 11he evaluation had7.2×106 showed,The clones, libraryqualification library independent with an of aboutmorethan0.5kbin rateof fragmentsaveragelength length,recombination frombuds ussuriensis 97%.eDNA Kom.wasconstructed librarytop ofPopulus successfully. 3045 18 Sequencedindependentclones,22high qualityexpressedsequencetags(ESTs) werediscoverfrom1944 were180 and1764 inthe1944 unigene.There contig singletons

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