拟南芥种子发育程转录组深度测序数据的分析.pdfVIP

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2015-11-01 发布于贵州
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拟南芥种子发育程转录组深度测序数据的分析.pdf

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Discipline：Science Subject：Biology Scienceand Specialty：BioinformaticTechnology Researchfield：GenomicBioinformatics Lin Postgraduate：Zhang Weiren Supervisor：Prof．Wu Submission2011 time：April of andInformation College Computer and FujianAgriculatureForestryUniversity Fuzhou350002 P．R．China 本人完全了解福建农林大学有关保留、使用学位(毕业)论文的规定，即学校有权送交论文的复印件，允许论文被查阅和借阅；学校可以公布论文的全部或部分内容，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。保密，在年后解密可适用本授权书。口．不保密，本论文属于不保密。一Ⅵf 学位(毕业)论文作者亲笔签名：M 日期：加f／．易．彳指导教师亲笔签名： l。凌咖． B觏：勿ffI易I 拟南芥种子发育过程转录组深度测序数据的分析目录 j-i要………………………………………………………………………………………………………………………………．．1 Abstract…………………………………………………………………………………………………………………………．3 i；I言………………………………………………………………………………………………………………………………．．5 文献综述……………………………………………………………………………………………7 1新—代测序技术…………………………………………………………………………。7 1．1测序技术的发展……………………………………………………………………7 1．2新一代测序技术的基本原理和比较……………………………………………．．8 1．3新一代测序技术的应用………………………………………………………．．13 7 1．4新一代测序技术的生物信息学分析工具………………………………………l 2转录组分析技术…………………………………………………………………………2l 2．1转录组分析技术平台……………………………………………………………2l 2．2RNA．Seq数据分析的一般流程…………………………………………………24 3拟南芥种子发育…………………………………………………………………………．26 3．1拟南芥胚的发育及其相关基因…………………………………………………27 3．2拟南芥胚乳的发育及其相关基因………………………………………………．29 3．3拟南芥种皮的发育………………………………………………………………．30 1 材料与方法………………………………………………………………………………………3