沙冬青转录组、RNA组及低温应答基因表达谱研究.pdfVIP

摘 要 沙冬青是我国荒漠地区最主要的超旱生常绿阔叶灌木树种，集抗1二旱、抗高 温、抗冻、耐腐蚀盐胁等多种抗逆性于一身，有多种抗逆性基因可待发掘与利用。 本文采用lllumina高通量测序技术，对沙冬青低温诱导蛋白调控过程的转录组和 小RNA组进行了研究，获得了大量mRNA和d、RNA的序列数据，首次建立了第 一个沙冬青叶片常温转录组数据库、首个沙冬青叶片低温胁迫应答基因的数字化 差异表达谱、以及沙冬青叶片低温胁迫与常温对照的dxRNA组及数字化表达谱。 获得以下主要结论： (1)沙冬青叶片常温下数字化转录组数据库获得727，480，454条reads数据， 拼接获得了59，141条Unigenes；其中25，55l条Unigenes与COG数据库中的基囚具 有相似性。对转录组中的Unigenes进行KEGG注释，分析结果表明，与生化代谢 通路相关的基因数量有4，650条，占比21．26％；与次生代谢物生物合成途径相关 的基因有2，138条，占1：1匕9．77％；与植物激素信号转导相关的基因有l，300条，占比 5．94％：最少的是与糖脂合成系列相关的基因，只有l条。 (2)对沙冬青叶片低温胁迫与常温对照两个表达谱数据库进行统计分析， 条；而能被KEGG 表达上存在差异的基因共有8，436条。这一结果表明，在低温胁迫下，沙冬青叶 片中多个代谢通路的性状调控基因的表达水平发生了明显改变。 (3)沙冬青叶片低温胁迫与常温对照的dxRNA数字化表达谱共有3，123，135 种、总计为13，204，830条小RNA序列信息，低温胁迫样品中的独特序列有 条，而没有比上任何注释信息的小IⅢA分别占到了两组d、RNA总量的51．74％和 49．38％，表明沙冬青低温胁迫存在着复杂的小RNA组及低温应答机制。 胁迫与常温对照)中未得到任何注释的候选miRNA前体进行分析，低温胁迫样 品和常温样品分别得N25个和18个新miRNA的茎环结构图、各位点碱基偏向性 及靶基因位点，为进一步解析沙冬青d、RNA低温胁迫调控奠定基础。 关键词：沙冬青；低温应答基因；转录组；表达谱；小RNA组；miRNA Abstract isthe andbroad-leaved Ammopiptanthus mongolicusonlysuper-xerophytic shrubindesertareaofChina．Kindsofresistancefrom evergreen genesA．mongolicus have valuesof andutilizationforthe large resistance exploitation comprenhensive characteristicof andalkali．In drought,hightemperature，cold temperature，corrosion this wascarriedoutto dissertation，Illumina high-throughputsequencing technology the ruleof in analyze cold—strssedA．