生物信息学综合实验2.pptVIP

生物信息学综合实验：Lab ? 信息检索 序列分析 软件应用 程序编写 超级细菌 Kumarasamy KK, Toleman MA, Walsh TR, Bagaria J, Butt F, Balakrishnan R, et al. Lancet Infect Dis 2010 JM Rolain, P Parola, G Cornaglia. Clin Microbiol Infect, 2010 序列搜寻 NCBI Blast Clustalw TreeView Modeller Modeller 下载：/modeller/9.10/modeller-9.10-1.i386.rpm 安装说明：/modeller/9.10/release.html#rpm 使用说明： /modeller/9.10/manual/node38.html Bonus MSA 复杂度：没有要求！ 语言：C/C++, Perl, Python, Fortran 作业 找出至少10条与NDM-1具有同源性的蛋白序列（FASTA），bonus：指出哪些序列不属于Metallo-beta-lactamase subclass II； 使用软件，执行多序列比对，构建系统无根树，bonus：编写MSA程序； 使用软件，构建NDM-1的同源结构模型； 实验报告：请具有可重复性 提交作业 本次作业