《基于稳定性的基因表达数据聚类算法选择》.pdfVIP

第25卷第5期 计．算机与应用化学 V01．25，No．5 2008年5月28Et and ComputersAppliedChemistry May，2008 基于稳定性的基因表达数据聚类算法选择 易辉，宋晓峰 (南京航空航天大学生物医学工程系，江苏，南京，210016) 摘要：聚类是一种常用的基因表达数据处理手段，然而它又是主观的，如何选择符合数据内在分布的聚类算法成为目前急待 解决的问题。根据经验，当选择最佳簇数k后，采用合理的聚类算法对目标数据重复聚类时，结果稳定性较好。因此提出一种 基于稳定性的聚类算法选择。该方法将聚类结果的簇间分离度、簇内紧致度和聚类结果稳定性三者结合起来。在验证和应 用三组数据时发现，比传统的评估方法，基于稳定性的聚类算法选择更客观、更可靠。 关键词：基因表达数据；聚类；稳定性；评估；选择 39 中图分类号：TP 文献标识码：A 文章编号2008)05—615—618 A selectionfor