神奇的结构生物学.pptVIP

liguofu xcxvvc How do you grow crystals? Start with very pure protein Create a supersaturated the solution Wait… 自旋量子数 I 不为零的核的自旋运动将产生磁矩,核磁共振的研究对象为具有磁矩的核。 原子核可按 I 的数值分为以下三类 中子数、质子数均为偶数，I =0，如12C、 16O、32S（没有核磁共振现象） 中子数与质子数其一为偶数，另一为奇数，则I为半整数（I＝1/2; 3/2)，如1H、13C、15N、19F、31P 中子数、质子数均为奇数，则I为整数，如2H、14N（I =1） 静态结构 晶体衍射 X-ray衍射 中子衍射 电子衍射 透射电镜 核磁共振(NMR) …….. 结构生物学的技术方法 结构变化 园二色光谱 (CD) 红外/拉曼光谱 荧光光谱 差示量然分析 (DSC) 电子顺磁共振 (EPR) 核磁共振(NMR) 原子力显微镜 (AFM) ……… /pdb/home/home.do Outline 生物大分子结构测定的方法 主要方法简介 进展评价 生物大分子结构与生命奥秘 e.g.1:ATPase e.g.2:dsDNA病毒DNA的包装马达 e.g.3:Influenza 的结构与医疗 什么是结构生物学 主要结构测定方法简介 X射线晶体学 核磁共振 (NMR) 透射电镜 最终结构 X射线晶体学的流程 晶体生长 晶体衍射 母晶 晶体重金属衍生物 傅里叶合成 电子密度图 晶胞参数 衍射强度和相位 两套以上不同 的衍射数据 根据结构模 型修正相位 碳骨架走向 氨基酸残基指认 结构模型 衍射强度 修正后的相位 Diffraction This X-ray diffraction pattern of a DNA-cleaving enzyme was imaged at the facility by the Barry Stoddard group from the Fred Hutchinson Cancer Research Center 电子密度图（electron density map） 分 辨 率的重要性 1? resolution 6? resolution 1.0??? 2.5??? 3.0??? 4.0??? 1.0 ?：可分辩单个原子（N比C大） 2.5 ?：可分辨环状状结构 3.0 ?：不易可分辨环状状结构 4.0 ?：很难确定是否环状结构. 6.0 ?：可分辨 a helix，不能分辨b sheet ≥8 ?：只能分辨分子 1.5 Angstrom resolution 核的自旋 NMR For I = ? nuclei have two spin states M = -1/2 M = +1/2 The energy gap between states is small and corresponds to radio frequency waves E = h ? 核磁共振的产生 NMR NMR NMR Spectroscopy 由NMR得到的结构参数 化学位移：电子对核自旋的屏蔽作用 原子核在分子中的位置 自旋耦合：核自旋间的相互作用 原子核之间的键合关系 化学键之间的夹角二面角 NOE效应: 核的空间距离 弛豫速率：核自旋间能量交换 原子核之间的距离 分子运动的相关时间 分子链段的柔性，及其势垒 NMR 主要结构测定方法简介 X-ray衍射 核磁共振 (NMR) 透射电镜 电镜原理 * 生物大分子结构与生命奥秘 e.g.1:ATPase e.g.2:dsDNA病毒DNA的包装马达 e.g.3:Influenza 的结构与医疗 Outline 什么是结构生物学 生物大分子结构测定的方法 主要方法简介 进展评价 ATPase 以膜两侧的[H＋]差为能量合成ATP ADP + Pi ? ATP + H2O e.g.1 ATPase 存在于线粒体内膜、叶绿体类囊体膜（和细菌质膜）上 FOF1 FO F1 Fo-ab2 Fo-cn F1-? ? F1- ?3 ?3 ? Fo-cn: Fo rotor F1-? ?/: F1 rotor Fo-ab2: Fo stator F1- ?3 ?3 ?: F1 stator Rotor Stator ATPase e.g.1 ATPase 象一台水力发电机 e.g.1 Asp or Glu ? Arg ATPase的转动机构/原理 (4) e.g.1 水轮机 e.g.1 ATP合成过程 e.g.1 e.g.2 线性双链DNA（ds DNA）病毒，包括噬菌体、腺病毒、 痘病毒、疱疹病毒等，在成熟过程中