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枣 庄 学 院
本科生毕业设计(论文)开题报告
题目: ISSR扩增产物检测方法比较
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指导教师:姓名 职称
学科
枣庄学院教务处制
年 月 日
一、选题依据(拟开展研究项目的研究目的、意义) Punicagranatum L.),属石榴科石榴属,落叶灌木或小乔木。石榴具有消炎、降血脂、血糖,降胆固醇,防止冠心病、高血压、糖尿病等多种功效。石榴具有较高的营养、药用和观赏价值 ,发展前景广阔。近年来对于石榴的研究主要集中在石榴皮、石榴叶,石榴籽等化学成分的提取以及生物活性的探究。
ISSR分子标记技术是研究植物遗传多样性的有力工具,能够直接从DNA水平上反映各材料间的遗传差别,方法简便快捷。 利用此方法可以确定各石榴品种间的亲缘关系,为有效地保护、利用石榴种质资源奠定基础。
本试验旨在通过比较聚丙烯酰胺凝胶电泳与琼脂糖凝胶电泳对石榴种质资源ISSR扩增产物的检测分析,确定一种分辨率更高的检测方法。
文献综述内容(在充分收集研究主题相关资料的基础上,分析国内外研究现状,提出问题,找到研究主题的切入点,附主要参考文献) ISSR(inter-simplesequencerepeats,ISSR)Zietkiewiczetal1994年提出的一种新型分子标记技术,被广泛用于检测SSR间DNA序列差异。ISSR技术的基本原理就是在SSR的3或5端加锚1-4个嘌呤或嘧啶碱基,然后以此为引物,对两侧具有反向排列SSR的一段DNA序列进行扩增,然后进行电泳、染色,根据谱带的有无及相对位置,来分析不同样品间ISSR标记的多态性。
近年来ISSR标记被广泛应用于动植物的遗传育种、动植物的遗传结构、微生物的种类鉴定以及遗传多样性分析等方面的研究。基因型不同的品种,或不同亲缘关系的物种,基因组内核苷酸序列存在差异,当使用ISSR引物对不同基因组体外扩增时,扩增产物表现出多态性。这种多态性反映了遗传多样性,利用遗传多样性的结果可以对种质进行聚类分析,进而了解其系统发育与亲缘关系,有利于探明近缘物种间的遗传同源性以及物种起源等生命科学领域中的重要问题。ISSR分子标记可以用来建立DNA指纹库。每个品种DNA指纹差异可直接提供与目标性状有关的DNA水平的信息,通过检测物种是否只具有该物种特有的标记指纹片段,可以有效地对种质进行聚类分析,ISSR标记快速、简便、可靠、多态性高、重复性好,是一种较好的指纹库构建方法,对品种鉴定和亲缘关系的分析具有重要作用。
汪斌等对红麻材料的ISSR-PCR扩增产物采用了1%的琼脂糖凝胶电泳分离,EB染色后在紫外灯下观察 ;刘欢等对燕麦材料的ISSR-PCR 扩增产物采用了8%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染法进行显色观察;王建波综述了目前植物ISSR-PCR扩增产物可用1.5%-2.0%的琼脂糖凝胶电泳分离, EB 染色后在紫外灯下观察,也可用5%-6%的聚丙烯酰胺凝胶电泳分离银染法进行显色观察。
综上所述,ISSR扩增产物检测方法可用1.5%~2.0%琼脂糖凝胶电泳或5%~6.0%PAGE分离 ,经EB或AgNO3染色后,统计带纹的有无及相对位置。由于检测方法不统一,本实验拟比较石榴ISSR扩增产物的两种检测方法的有效性,筛选一种适合石榴ISSR扩增产物的较好方法。
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